Ett ekosystem är en naturlig enhet som består av den abiotiska (icke-levande) delen av en miljö som interagerar med de biotiska (levande) växterna och djuren som är anpassade till den. Det finns hundratals ekosystem på planeten, indelade i primära kategorier (dvs. öken) och många underkategorier (dvs. Western Australia Desert). De viktigaste ekosystemen på planeten är marina ekosystem, inklusive den fotografiska zonen (inom 200 m från ytan) och den avgrundsslätten (havsbotten). Konceptet med ett ekosystem är mycket likt det för en biom.
De viktigaste ekosystemen på planeten förutom akvatiska ekosystem är taiga (kanadensiska och sibiriska barrskogar), gräsmarker (som täcker större delen av Asien och Nordamerika) och det djupa underjordiska ekosystemet, som sträcker sig 2-4 miles under jordens yta och är främst befolkad av bakterier. Det senare är också känt som Subsurface Lithoautotrophic Microbial Ecosystem och är ett av de minst studerade ekosystemen på jorden, trots att det är ett av de största. En stor del av planeten kan också betraktas som människoinfluerade ekosystem, eftersom människor är så många och ingriper så ofta i naturen att få regioner är orörda.
Ekosystem definieras ofta i termer av primärproducenter (vegetation), som fungerar som basen för ekosystemet och som allt annat äter, antingen direkt (konsumenter) eller indirekt (rovdjur). I grov närhet till ekvatorn är några stora ekosystem som definieras av vegetation tropisk regnskog, subtropisk regnskog, barrskog, gräsmarker, taiga och tundra. Dessa är blandade med bergiga och öken-ekosystem, alla med sin egen unika flora och fauna. Det finns också ett antal mänskliga stora ekosystem, såsom odlingsmarker och städer.
Det viktigaste terrestra stora ekosystemet är regnskog – regnskogar innehåller mer än hälften av all biologisk mångfald, kanske så mycket som 80 %. Tyvärr är regnskogar också ett av de snabbast försvinnande ekosystemen, förstört av markröjning för jordbruk. Om inte denna markröjning aggressivt stoppas, kan regnskogar försvinna år 2100 eller tidigare.