Den största skillnaden mellan nationell kultur och företagskultur ligger i området för förväntningar från dessa två separata men relaterade begrepp. De två begreppen är separata eftersom de representerar två olika begrepp. Nationell kultur hänvisar till en nations vallar, vilket inkluderar aspekter som frågan om moral, påklädning, mat, dans, sånger, språk och andra relaterade saker. Organisationskultur relaterar till hur en organisation är strukturerad och drivs. Det inkluderar faktorer som typen av relation mellan anställda och ledning, välfärdspaketet för anställda och vilken typ av beteende företaget förväntar sig av sina anställda.
Skillnaderna och likheterna mellan den nationella kulturen och företagskulturen blir allt mer korsade med globaliseringens framväxt. Globaliseringens effekter gör att organisationer från olika nationer etablerar sig i olika länder. I själva verket förstoras chanserna för nationella kulturer och organisationskulturer att negativt krocka när organisationer är belägna i länder med mycket olika nationella kulturer. Till exempel kan en organisation med en organisationskultur som förväntar sig att sina anställda bara klä sig i smarta kostymer komma i konflikt med kulturen i en nation där medborgarna tillåts gå till jobbet iförda traditionella kläder.
Ett annat område där den nationella kulturen och företagskulturen kan krocka är inom arbetstid. Om ett land har en nationell kultur att iaktta en viloperiod eller siesta på eftermiddagen en liten stund, kan detta krocka med en organisationskultur som bara tillåter sina anställda att ha en 30-minuters paus för lunch. En nationell kultur kan förvänta sig att en blivande mamma stannar hemma i minst ett år efter förlossningen för att ta hand om det nya barnet. Däremot kan organisationskulturen vara att en kvinna bara har tre månaders mammaledighet.
Den bästa policyn för ett företag som försöker etablera sig utomlands är att se till att det väljer länder med nationella kulturer som stämmer överens med dess organisationskultur. I situationer där landet i fråga ger lukrativa möjligheter för organisationen, kan en sådan organisation behöva anpassa sin organisationskultur för att tillgodose landets nationella kultur. Ett exempel är ett oljebolag som mestadels etablerar sina kontor i länder med reserver av råolja. Dessa typer av företag överväger ofta skillnaden mellan den nationella kulturen och företagskulturen. Detta beror på att oljereserverna kan vara belägna på platser med nationella kulturer som avsevärt skiljer sig från deras organisationskulturer.