Untuk sebagian besar pasien, penggunaan metronidazol untuk giardiasis akan dengan cepat dan efektif mengobati infeksi oleh mikroorganisme ini. Dalam kebanyakan kasus, infeksi sembuh setelah satu pengobatan, meskipun beberapa pasien mungkin memerlukan beberapa kursus untuk benar-benar menyingkirkan parasit. Namun, ada beberapa jenis giardiasis yang telah menjadi resisten terhadap obat ini, dan untuk pasien dengan jenis giardiasis ini, menggunakan metronidazol untuk giardiasis mungkin bukan pengobatan yang efektif. Meskipun metronidazol dianggap sebagai pengobatan yang efektif, obat lain dengan tingkat keberhasilan yang lebih tinggi dan efek samping yang lebih sedikit digunakan di sebagian besar dunia.
Antara 85 dan 90 persen pasien yang diberi resep metronidazol untuk giardiasis benar-benar pulih setelah mengonsumsi satu antibiotik ini. Dalam kebanyakan kasus, pasien diberikan tiga tablet 250 miligram untuk dikonsumsi selama lima hari. Suspensi cair obat ini dapat diberikan kepada anak-anak atau pasien yang tidak dapat menelan pil. Setelah pengobatan ini selesai, dokter harus memeriksa tinja pasien untuk menentukan apakah ada giardiasis.
Pasien yang tidak sembuh dari infeksi giardiasis setelah pengobatan pertama mungkin diminta untuk mencoba pengobatan lagi. Dosis dan durasi waktu biasanya sama untuk perawatan selanjutnya. Beberapa pasien dapat terus dites positif untuk giardiasis, dalam hal ini penggunaan metronidazol untuk giardiasis akan dianggap tidak efektif untuk pasien tersebut.
Meskipun menggunakan metronidazol untuk giardiasis dianggap sebagai obat yang efektif dan masih merupakan obat yang paling banyak digunakan untuk mengobati giardiasis di beberapa bagian dunia, termasuk Amerika Serikat, perawatan lain lebih efektif. Tinidazole, obat yang berhubungan dengan metronidazol, melaporkan tingkat kesembuhan 90 persen yang konsisten hanya dengan satu pil. Obat lain yang tidak tersedia di seluruh dunia, quinacrine, dapat menyembuhkan antara 90 dan 95 persen pasien. Efek samping yang dialami banyak pasien dengan penggunaan metronidazol seringkali lebih parah daripada yang disebabkan oleh pengobatan yang lebih baru.
Pengobatan giardiasis memerlukan obat kuat seperti metronidazol karena infeksi disebabkan oleh protozoa, bukan bakteri atau jamur. Meskipun menggunakan metronidazol untuk giardiasis tidak seefektif pengobatan giardiasis lain di pasaran, itu masih merupakan pengobatan yang berharga dan relatif murah untuk kondisi ini. Ini sangat efektif melawan sebagian besar jenis giardiasis, meskipun beberapa mutasi pada organisme ini membuat mereka resisten terhadap obat ini.