Dalam pengertian yang paling ilmiah dan biologis, perbedaan utama antara cod dan haddock adalah jenis spesiesnya. Kedua ikan tersebut sebenarnya termasuk dalam famili gadidae yang sama, tetapi bercabang menjadi genus yang berbeda, dengan haddock di bawah genus melanogrammus, dengan cod menjadi anggota genus gadus. Secara keseluruhan, perbedaan spesies antara cod dan haddock ini sebagian besar menjelaskan perbedaan penampilan, kebiasaan makan, dan habitat.
Ikan-ikan ini bisa sangat mirip dalam penampilan, tetapi perbedaan yang paling jelas antara kedua ikan ini adalah gurat sisinya yang membentang dari kepala hingga ekor. Cod memiliki gurat sisi pucat berwarna keputihan, sedangkan haddock memiliki gurat sisi hitam gelap, disertai beberapa bercak pada sirip dada yang terletak di sisi kepala. Haddock memiliki sirip punggung utama yang lebih panjang dan runcing, terletak di punggung ikan yang paling dekat dengan kepala, dibandingkan dengan cod. Ekor haddock juga memiliki penampilan yang lebih cekung daripada ujung ekor cod yang lebih tumpul. Kedua ikan juga berbeda dalam warna: cod tampaknya memiliki semburat kehijauan, kekuningan, sedangkan haddock memiliki warna keabu-abuan, keperakan.
Kedua ikan tersebut hidup pada kisaran yang sama, seperti di Atlantik Utara dan Teluk Maine. Kedalaman tempat tinggal mereka, bagaimanapun, berbeda karena cod hidup di perairan yang lebih dangkal daripada haddock yang mencari perairan yang lebih dalam. Ikan kod banyak sekali di kedalaman 5 hingga 10 depa (9.14 hingga 18.28 meter), sementara haddocks mengisi perairan dengan kedalaman 20 hingga 70 depa (36.57 hingga 128.01 meter). Ini mungkin mengapa cod lebih rentan terhadap penangkapan ikan yang berlebihan daripada haddock. Faktanya, World Wide Fund (WWF) mendaftarkan cod sebagai spesies yang terancam punah pada tahun 2000, dan pada 2010, cod Atlantik ditempatkan pada “daftar merah makanan laut” Greenpeace International.
Dilihat dari kebiasaan makannya, ikan kod dan haddock memakan makanan sejenis seperti teripang, cacing, bintang rapuh, dan moluska. Perbedaannya adalah bahwa cod memakan kerang dan kepiting berukuran lebih besar, sedangkan haddocks tidak. Haddocks juga memakan lebih banyak cacing daripada cod, mungkin karena cacing laut berlimpah di dekat dasar laut. Cods, di sisi lain, bahkan akan mencoba menangkap bebek laut kecil di dekat permukaan air.
Seorang pemancing ahli atau pemancing mungkin tahu perbedaan antara cod dan haddock, tetapi bahkan koki dapat mendeteksi perbedaan dalam hal tekstur dan teks. Cod sedikit lebih lembut daripada haddock ketika ditekan dengan lembut, indikasi perbedaan tekstur daging. Daging cod lebih lembab dan montok, sedangkan haddock bisa memiliki konsistensi yang bersisik dan kering. Cod dan haddock keduanya rasanya sama, tetapi banyak juru masak mengatakan haddock memiliki rasa yang lebih manis.