USS Thresher adalah kapal selam angkatan laut Amerika yang hilang pada tahun 1963 selama latihan menyelam dalam. Nasib USS Thresher memicu sejumlah kekhawatiran tentang keselamatan kapal selam bertenaga nuklir, dan mendorong Angkatan Laut Amerika Serikat untuk membuat program keselamatan untuk memberikan pelatihan yang ditingkatkan dan tanggap bencana. Program ini, yang dikenal sebagai SUBSAFE, memberikan kontrol kualitas dan jaminan keamanan untuk seluruh armada bertenaga nuklir.
Kapal selam ini adalah kapal terdepan di kelasnya, yang berarti kapal selam ini adalah yang pertama dibangun dengan spesifikasi yang baru. Nomor lambung USS Thresher adalah 593, dan secara teknis kapal selam yang dibangun setelah USS Thresher seharusnya dikenal sebagai kapal selam kelas Thresher atau 593, tetapi mereka disebut sebagai Permit atau kapal selam kelas 594, setelah kapal kedua di kelas tersebut, karena untuk takhayul tentang mengacu pada kapal yang telah hilang di laut. Kelas Izin telah digantikan oleh model baru kapal selam nuklir berikutnya.
Secara resmi ditugaskan pada tahun 1961, USS Thresher dibawa melalui uji coba laut yang luas oleh kapten dan awaknya. Kapal selam tersebut mengalami beberapa masalah kecil selama periode uji coba lautnya, termasuk masalah dengan tangki pemberat dan reaktor nuklir. Dengan uji coba laut yang akhirnya selesai, USS Thresher dibawa ke laut lepas pantai Massachusetts untuk pelatihan menyelam laut dalam, ditemani oleh USS Skylark, kapal penyelamat kapal selam, pada 9 April 1963.
USS Thresher tenggelam ke kedalaman yang diharapkan, dan kemudian melaporkan bahwa ia mengalami masalah dan berusaha muncul ke permukaan. Laporan itu kacau, dan kapal selam itu tidak pernah terdengar lagi. USS Skylark melaporkan kapal itu hilang, dan upaya diluncurkan untuk mengidentifikasi puing-puing dan menentukan apakah reaktor bocor atau tidak. USS Thresher tenggelam di perairan yang cukup dalam untuk menyebabkan kapal meledak dengan tekanan, menewaskan 129 pelaut di dalamnya dalam waktu kurang dari dua detik dan membuat kapal tercerai-berai di dasar laut menjadi enam bagian. Survei radiologis rutin gagal menemukan tanda-tanda bahwa bahan bakar nuklir kapal telah mencemari daerah tersebut.
Penelitian tentang nasib USS Thresher tampaknya menunjukkan bahwa kapal itu tenggelam karena kegagalan dalam sistem perpipaan air asinnya yang pada akhirnya menyebabkan kapal selam membanjiri, mematikan reaktor nuklir. Sebelum awak kapal selam bisa menyalakan reaktor kembali, kapal itu tenggelam. Pemulihan bangkai kapal USS Thresher tidak dapat dilakukan karena kedalaman kapal selam dan kekhawatiran tentang kontaminasi nuklir, dengan beberapa tugu peringatan untuk kapal dan awaknya berada di berbagai lokasi di Amerika Serikat, termasuk Pemakaman Nasional Arlington.