Cabang antropologi yang dikenal sebagai arkeologi gender berusaha untuk memajukan pemahaman kita tentang peran pria dan wanita dalam budaya manusia purba. Pendiri cabang arkeologi ini mengklaim bahwa seorang arkeolog gender membutuhkan tingkat pembuktian yang lebih tinggi sebelum merumuskan teori atau sampai pada kesimpulan. Metodologi yang digunakan saat memeriksa situs pemakaman mungkin termasuk analisis kerangka, kimia, dan mikroskopis; investigasi mendalam terhadap artefak pemakaman; dan studi banding makam lainnya. Beberapa percaya bahwa arkeologi gender dimulai dengan gerakan feminis dan berpendapat bahwa penelitian ini muncul dalam upaya untuk mengangkat peran perempuan dalam sejarah manusia. Pendukung arkeologi gender mengklaim bahwa studi budaya konvensional sering salah menafsirkan data berdasarkan ide-ide yang terbentuk sebelumnya.
Banyak pengertian umum dalam studi antropologi yang mencirikan laki-laki memiliki posisi politik, agama, dan sosial yang dominan. Arkeologi gender lebih suka memeriksa sejarah berdasarkan bukti fisik daripada secara otomatis menetapkan peran berdasarkan ciri-ciri seks biologis. Banyak yang mengusulkan bahwa laki-laki, yang dianggap lebih kuat secara fisik daripada perempuan, membuat alat dan menerima tanggung jawab berburu dan berkelahi sementara perempuan bertanggung jawab untuk membesarkan anak, mengumpulkan, dan tugas-tugas rumah tangga biasa. Berdasarkan artefak dan bukti kerangka, bukti arkeologi yang lebih baru menunjukkan bahwa dalam beberapa budaya, laki-laki berbagi dalam membesarkan anak dan tanggung jawab domestik lainnya dan bahwa perempuan menciptakan alat.
Budaya kuno sering mengubur laki-laki berbaring di sisi kanan dengan kepala menghadap ke timur atau utara sementara perempuan ditempatkan di sisi kiri dengan kepala menghadap ke selatan atau barat. Para arkeolog sering mengklasifikasikan jenis kelamin jenazah berdasarkan posisi penguburan sampai arkeologi gender menggali lebih dalam dengan melakukan pengujian asam deoksiribonukleat (DNA) pada jenazah. Beberapa tubuh, yang awalnya dianggap perempuan, ternyata adalah laki-laki.
Investigasi artefak pemakaman di berbagai budaya mengungkapkan bahwa beberapa masyarakat percaya pada jenis kelamin ketiga, atau individu dua roh, yang sering bertindak sebagai petugas pemakaman, dukun, atau pemimpin agama lain yang sangat bergengsi di masyarakat. Selama beberapa penyelidikan, tubuh yang dihiasi dengan perhiasan awalnya dianggap perempuan. Penyelidikan lebih lanjut telah menunjukkan bahwa kedua jenis kelamin mengenakan perhiasan di beberapa budaya dan bahwa jumlah dan penempatan perhiasan lebih akurat menentukan jenis kelamin individu.
Di beberapa masyarakat, wanita memperoleh status seiring bertambahnya usia. Seorang arkeolog gender yang mempelajari seluruh kuburan menemukan bahwa seiring bertambahnya usia wanita di komunitas tertentu, masyarakat mengubur mereka dengan pakaian dan artefak yang lebih mewah. Arkeologi gender juga menemukan bahwa laki-laki dari berbagai budaya tidak selalu memiliki kekuatan politik dan sosial. Artefak dan sisa-sisa di sebuah makam yang ditemukan di tengah Eropa dan bertanggal sekitar 500 SM, mengungkapkan situs pemakaman seorang putri yang mungkin. Makam luas lainnya yang ditemukan di Korea, dan bertanggal sekitar 400 M, menunjukkan tempat peristirahatan terakhir seorang ratu.