Att ta zolpidem under graviditet anses allmänt vara säkert när det är nödvändigt för att behandla sömnlöshet, men gravida patienter uppmanas ofta att prova andra alternativ först. Detta beror på att detta läkemedel har rankats i graviditetskategori C av US Food and Drug Administration (FDA). Detta beror sannolikt på att djurstudier som utförts på zolpidem under graviditet har visat några negativa biverkningar, även om det inte finns några ordentligt kontrollerade studier på människor som med säkerhet kan säga om det är säkert. I allmänhet tenderar läkare bara att förskriva detta läkemedel till gravida patienter när sömnlösheten är tillräckligt allvarlig för att ha en negativ effekt, då fördelarna kan uppväga riskerna.
Djurstudier som har utförts med detta läkemedel har visat vissa negativa effekter för fostret, även om djuren ofta fick mycket högre doser än gravida kvinnor normalt skulle få. Till exempel hade vissa försökspersoner som fick höga doser zolpidem under graviditeten foster som visade ofullständig förbening av skallen. Dessutom ökade graden av missfall och hämmad tillväxt hos fostret när dosen av zolpidem ökades. I många fall har dock normala doser av zolpidem under graviditet inte visat sig ha en negativ effekt på fostret eller modern.
Det har gjorts några mindre studier på kvinnor som tog zolpidem under graviditeten och även om de inte nödvändigtvis kontrollerades ordentligt, visar deras resultat att det finns en viss risk med att ta detta läkemedel. Till exempel rapporterade vissa kvinnor som tog drogen under tredje trimestern allvarlig andningsdepression hos sitt nyfödda barn, men detta kan vanligtvis behandlas på sjukhuset så att effekterna inte är långsiktiga. En ytterligare oro för zolpidem under graviditeten är möjligheten att barn kommer att födas beroende av drogen. Nyfödda zolpidemberoende kännetecknas ofta vid födseln av abstinenssymtom som kan innefatta svettning, kräkningar och muskelsmärtor. Slutligen, vissa nyfödda barn verkar slappa och svaga vid födseln när de har exponerats för zolpidem i livmodern.
Mödrar som vill undvika dessa möjliga effekter uppmuntras att hitta alternativ till att ta zolpidem under graviditeten och bör endast ta detta läkemedel när deras sömnlöshet är extrem och inget annat fungerar för att behandla det. I de flesta fall bör sömnlösheten försvinna efter graviditeten; om det inte gör det kan detta läkemedel ordineras utan incidenter. Ammande mödrar bör dock följa samma försiktighetsåtgärder som gravida kvinnor när de tar detta läkemedel, eftersom det visar sig i bröstmjölk och effekten på ammande spädbarn är okänd.