Det finns i grunden tre typer av e-handelsprogram: ett färdigt program, ett specialkodat program och ett program som tillhandahålls av ett webbhotell för e-handel. Dessa alternativ kan ytterligare delas in i mer specifika typer av e-handelsprogram. Användningen av en relationsdatabas, tillgång till redovisningsapplikationer inifrån programvaran och närvaron eller frånvaron av en kundvagn är några av de funktioner som bestämmer olika typer av e-handelsprogram.
Termen ”e-handel” syftar på elektronisk handel, eller förmågan att sälja och köpa varor och tjänster med hjälp av Internets teknik. Typen och storleken på företaget hjälper till att avgöra vilken typ av e-handelsprogramvara som den behöver. Till exempel kanske en kommersiell webbplats som bara säljer ett fåtal varor inte behöver programvara som innehåller en kundvagn om det är ovanligt att kunder köper mer än en vara eller tjänst åt gången. Stora företag som erbjuder många olika produkter, å andra sidan, kan tycka att det är absolut nödvändigt att ha programvara där det finns en kundvagn. Kunder vill ofta köpa flera varor eller tjänster med en transaktion.
Närvaron av en relationsdatabas tenderar också att vara mycket viktig när man säljer många varor och tjänster. Detta gäller särskilt när föremål finns i olika storlekar, färger och kvantiteter. Relationsdatabaser i e-handelsprogramvara kan ses som ett lagersystem som kan uppdateras i farten, vilket hindrar kunder från att beställa varor som är slut i lager eller som inte längre är tillgängliga. Små företag kan vara intresserade av e-handelsprogram som har ett integrerat redovisningsprogram.
Alla dessa typer av e-handelsprogram måste studeras noggrant för att överväga fördelar och nackdelar. Out-of-the-box mjukvara är i allmänhet att föredra av individer eller mycket små företag som inte har någon kunskap om webbutveckling. Fördelarna inkluderar friheten att koda programvaran för att möta verksamhetens specifika behov och krav. Programmeringskunskaper, dock, och en gedigen förståelse för hypertext mark-up language (HTML) krävs om inte tjänster från en webbutvecklare kan köpas. Denna typ av programvara kan erhållas gratis eller mot en avgift.
Programvara som inte är kodad från början måste konfigureras eller ”justeras” av varje individ eller företag som planerar att använda den. Beroende på programvarans storlek och funktioner kan det räcka, men det kan vara ”bulkigt” för ett litet företag. E-handelsprogram som är värd kan kräva att en vanlig avgift betalas, och det kan finnas begränsningar för användningen av applikationen.