Frågan om huruvida hjärnstorleken påverkar intelligensen diskuteras hårt inom vetenskapen, och det finns ingen säkerhet i frågan. Det finns bevis som tyder på att hjärnstorlek kan göra skillnad, men det finns också bevis som tyder på att det inte är den viktigaste faktorn. Enligt vissa experter verkar hjärnstorlek vara viktigare för vissa typer av intelligens än andra. Det finns studier i djurriket som också har visat på stora motsägelser vad gäller hjärnstorlek och intelligens bland olika arter, och detta har generellt gjort forskarna mer osäkra i frågan.
Djur som har gjort forskarna mest osäkra är fåglar. Många fågelarter, särskilt de i kråkfamiljen, uppvisar mycket komplicerade sociala beteenden och visar förmågan till komplexa resonemang. De klarar i allmänhet av detta trots att deras hjärnor är mindre än många arter med mindre formidabla kognitiva förmågor. Vissa experter tror att detta beror på att fåglar har särskilt komplexa neuronstrukturer som gör att deras hjärnor kan bli mer effektiva.
Det finns också andra studier som visar ett starkt direkt samband mellan hjärnstorlek och intelligens. Dessa studier har undersökt intelligenstester över ett brett spektrum av arter och har fokuserat på en mer generell typ av problemlösningsförmåga. Orsaken till dessa resultat är omtvistad. Vissa experter tror att bara att vara större fysiskt gör att djuren kräver mer intelligens av någon anledning, medan andra tror att hjärnstorleken är den primära faktorn.
Hos människor har studier av hjärnstorlek och intelligens också varit relativt motsägelsefulla. Till exempel har de flesta män större hjärnor än de flesta kvinnor, men studier har inte kunnat hitta statistiskt signifikanta skillnader i intelligens mellan män och kvinnor. Det finns många fall där personer med mycket mindre hjärnor har kunnat visa mycket mer mental kapacitet än människor med större hjärnor. Det är i allmänhet sant att hjärnstorlek och kroppsstorlek vanligtvis är proportionellt relaterade bland människor, men intelligens och kroppsstorlek är ofta helt orelaterade.
Vissa experter tror att hjärnans struktur, eller kanske den specifika storleken på vissa delar av hjärnan, har mer att göra med intelligens. Det finns också bevis för att hjärnstorleken förändras baserat på en persons erfarenhet, och när människor får mer mental kunskap kan deras hjärnor faktiskt växa. Det finns många bevis som tyder på att detta händer under barndomsåren när människor utvecklas, men det finns också vissa bevis som visar att det händer efter att människor når vuxen ålder också.