Bendera negara bagian Missouri dirancang oleh Marie Elizabeth Oliver, yang merupakan istri Senator Robert Burett Oliver. Dalam kebanyakan kasus, ide untuk merancang bendera negara bagian Missouri dikaitkan dengan komite yang dibuat oleh Putri Revolusi Amerika pada tahun 1908. Selama hampir 92 tahun, Missouri telah ada sebagai negara bagian tanpa bendera negara bagian. Sementara desain Oliver selesai untuk bendera negara ada pada awal 1909, itu tidak menjadi bendera resmi negara sampai 22 Maret 1913.
Sementara bendera Oliver adalah favorit pada saat itu, ada bendera negara bagian Missouri yang dipertimbangkan secara serius oleh Senat. Bendera ini dirancang oleh Dr. GH Holcomb. Tidak jelas apakah ide untuk sebuah bendera sangat populer di kalangan orang Missouri, tetapi didokumentasikan bahwa pengesahan RUU yang menetapkan bendera resmi negara bagian Missouri membutuhkan beberapa upaya. Pada tahun 1913, Gubernur Elliot Major akhirnya menandatangani RUU tersebut, dan bendera tersebut menjadi resmi.
Untuk memahami mengapa proposisi Oliver untuk bendera negara bagian Missouri berhasil, penting untuk mempertimbangkan kualitas yang diinginkan dalam bendera negara bagian. Kebanyakan orang yang terlibat dalam proyek ini merasa bahwa desain alternatif yang diusulkan oleh Holcomb tidak cukup mewakili kemerdekaan negara karena kemiripan bendera dengan bangsa. Bendera Oliver kaya secara simbolis, termasuk sejumlah gambar yang kuat tanpa terlalu rumit untuk direproduksi. Gambar-gambar itu, termasuk bintang, helm, dan beruang, dipilih secara khusus untuk mewakili gagasan dan fakta tentang Missouri yang dianggap sangat relevan pada saat itu. Meskipun karakter Missouri telah berubah selama bertahun-tahun, bendera itu sendiri adalah catatan sejarah tentang bagaimana orang melihat Missouri pada tahun 1913.
Sejarah bendera negara bagian Missouri tidak berakhir pada tahun 1913, melainkan berlanjut hingga hari ini. Selama bertahun-tahun, keluarga Oliver mempertahankan bendera asli yang dijahit oleh istri Senator, tetapi pada tahun 1961 bendera itu disumbangkan ke negara. Itu ditampilkan selama bertahun-tahun sampai kerusakan karena usia memerlukan penyimpanan untuk pelestariannya sendiri.
Pada tahun 1988, peringatan 75 tahun pembuatan bendera menginspirasi minat baru pada objek aslinya. Untuk memperingati peristiwa tersebut, siswa sekolah dasar di Missouri mengumpulkan uang agar bendera tersebut dipulihkan dan dipajang kembali. Dengan metode pengarsipan modern dan pengabdian untuk melestarikan sejarah Missouri, bendera kemungkinan akan tetap dipajang di Pusat Informasi Negara Bagian James C. Kirkpatrick di Kota Jefferson, Missouri selama bertahun-tahun.