Mikropenis adalah penis yang biasanya terbentuk tetapi jauh lebih kecil dari rata-rata. Pada bayi laki-laki, ini ditunjukkan dengan panjang kurang dari 0.75 inci (1.9 sentimeter) saat diregangkan. Pada pria dewasa, ukuran yang memenuhi syarat adalah 3 inci (7.62 sentimeter) saat ereksi penuh. Ada banyak kondisi yang dapat menyebabkan penis yang sangat kecil, tetapi umumnya, produksi atau asimilasi testosteron terlibat.
Hipogonadisme pria adalah istilah medis luas yang menggambarkan penurunan produksi testosteron. Ada banyak diagnosis dengan hipogonadisme sebagai gejala, dan sebagian besar kondisi yang dimulai pada masa bayi atau remaja dapat menyebabkan mikropenis. Hipogonadisme dibagi lagi menjadi kelas primer dan sekunder.
Pada hipogonadisme primer, penurunan kadar testosteron disebabkan oleh kerusakan pada testis pria. Ketika mikropenis muncul pada bayi laki-laki, kadang-kadang merupakan akibat dari hipogonadisme yang disebabkan oleh sindrom Klinefelter. Individu dengan sindrom Klinefelter memiliki kromosom X ekstra, yang sering mengakibatkan malformasi testis dan penurunan produksi testosteron.
Cedera pada testis sebelum atau selama masa remaja awal dapat menyebabkan hipogonadisme primer dan akhirnya menyebabkan mikropenis. Cedera akibat trauma fisik jelas berbahaya, tetapi kerusakan testis akibat infeksi gondok juga mungkin terjadi. Kelebihan kadar zat besi dalam darah juga dapat, dalam kasus yang jarang terjadi, menyebabkan keterbelakangan.
Pada hipogonadisme sekunder, testis tidak menerima sinyal untuk memproduksi testosteron. Dalam kasus ini, biasanya ada kerusakan pada kelenjar hipofisis atau hipotalamus. Ini dapat disebabkan oleh kelainan genetik seperti sindrom Kallmann atau akibat sejumlah kelainan hipofisis. Obesitas juga telah disejajarkan dengan hipogonadisme sekunder.
Pada masa bayi, mikropenis sering diobati dengan suntikan testosteron jangka pendek. Jika penis menunjukkan peningkatan pertumbuhan setelah tiga bulan, diasumsikan bahwa peningkatan hormon pada masa pubertas juga akan menghasilkan peningkatan panjang. Untuk pria dewasa, beberapa potensi untuk meningkatkan ukuran telah ditunjukkan dengan menggunakan implan bedah. Beberapa obat herbal telah dipasarkan dengan jaminan untuk memperpanjang panjang penis. Tidak ada studi ilmiah independen untuk membuktikan klaim ini secara memadai.
Di masa lalu, orang tua dari anak laki-laki yang lahir dengan mikropenis terkadang disarankan agar anak mereka menjalani operasi penggantian kelamin. Dalam kasus yang jarang terjadi, ketika anak memiliki penis dan vagina, nasihat ini hampir universal. Ketika efek emosional yang serius mulai muncul pada anak-anak ini pada masa remaja, praktik tersebut diuji ulang. Sejak itu sebagian besar telah ditinggalkan.