Lönen för en flygledare påverkas av en mängd olika faktorer som inkluderar individens akademiska meriter, arbetslivserfarenhet, arbetsplats och specifika ansvarsområden. I de flesta länder är flygledare statsanställda och några av dessa personer är anställda av militära grenar. Även om specifika ansvarsområden kan variera, är flygledare ytterst ansvariga för att se till att flygplan säkert kan starta och landa på särskilda flygplatser eller andra platser.
I de flesta fall måste flygledare ha avlagt en högskoleexamen i flygteknik eller ett relaterat ämne. Lönen för en flygledare kan variera beroende på den högskola som individen gick på eftersom vissa arbetsgivare betalar en premie för att rekrytera akademiker från större universitet. Dessutom erbjuder vissa universitet forskarutbildningsprogram och de som slutför sådana program kan vanligtvis få högre löner än sina motsvarigheter.
Tillsynsmyndigheter för civil luftfart i många länder administrerar utbildningsklasser för flygledare och personer inom byråns jurisdiktion måste genomgå en av dessa kurser innan de söker anställning som flygledare. Utbildningskurser är mer rigorösa i vissa länder än andra och lönerna för kvalificerade controllers anpassas därefter. Vissa utbildningar förbereder eleverna för att arbeta på lågvolymflygplatser medan andra syftar till att förbereda människor att arbeta på stora internationella knutpunkter. Utbildningens djup påverkar så småningom individens lön.
Liksom många arbetsgivare ger flygplatsoperatörer ofta löneökningar till rutinerade anställda. Eftersom nyrekryteringar måste arbeta under ledning av seniora anställda, får veterankontrollanter vanligtvis mer betalt än sina juniora motsvarigheter. Även om lönen för en flygledare direkt påverkas av individens erfarenhetsnivå, kan lönerna också påverkas negativt om flygledare har en historia av att göra misstag. Tillsynsmyndigheter i många länder har möjlighet att stänga av felbenägna kontrollanter och detaljer om tidigare misstag hindrar ofta sådana individer från att gå in i högre betalande roller.
Levnadskostnaderna varierar från land till land, men även inom en nation är de dagliga utgifterna mycket högre i vissa områden än andra. Därför beror lönen för en flygledare delvis på var flygledaren är baserad. Dessutom måste vissa avlägsna flygplatser betala högre lön än genomsnittet för att locka till sig kvalificerade flygledare.
Både små och stora flygplatser har flygledare och lönen för dessa individer beror delvis på deras arbetsvolym. Vissa små flygplatser har bara ett litet antal flygningar per dag i vilket fall flygledaren kan vara anställd på deltid. Stora flygplatser anställer flygledare på heltid, av vilka några måste arbeta under natten. I många fall betalar arbetsgivare högre lön till kontrollanter som måste arbeta långa pass och de som arbetar nattskift.