Fördelarna med sockerrörsetanol är mycket uppenbara, särskilt jämfört med majsbaserad etanol. Sockerrör kan, pund för pund, producera mycket mer energi än majs, delvis eftersom det är lättare att producera sockerrörsetanol. Majs kräver ytterligare enzymer, vilket lägger till fler steg och kostnader till processen. Sockerrör erbjuder också andra fördelar.
Medan majs ofta odlas under varierande förhållanden, vilket gör det svårt att avgöra hur mycket som kommer att finnas tillgängligt från år till år, särskilt för enskilda majsbaserade etanolväxter, är sockerrörsetanol mycket mer förutsägbart. Sockerskörden, i den del av världen där den omvandlas till etanol, förblir relativt stabil år efter år i motsats till grödor som odlas i majsbältet i USA. Medan Mellanvästern i USA erbjuder några av de mest bördiga jorden i världen, kan många andra saker påverka majsgrödan. Skadedjur, torka, översvämningar, till och med hårda vindar, kan alla orsaka förödelse på majs. Även om detsamma kan sägas om sockerrör, verkar det klara stormen lite bättre.
En annan fördel med sockerrörsetanol är dess skördecykel. Majs planteras varje år, vanligtvis på våren, och skördas sedan på hösten. Det finns bara en skörd per planteringscykel. Sockerrör erbjuder dock fördelen med, i vissa fall, upp till sju skördar innan omplantering behövs. Det kan alltså vara mycket mer energi- och kostnadseffektivt att producera etanol från sockerrör.
Dessa faktorer kan göra stor skillnad av ett antal anledningar. Sockerrör kan ta sig till bearbetningsanläggningar mer konsekvent och förutsägbart. Det finns mycket liten anledning för en etanolfabrik för sockerrör att oroa sig för att en producent inte kommer att kunna uppfylla sina avtalsenliga skyldigheter. Även om detta också kan vara sant för majs för det mesta, kommer det att finnas år då det inte heller är sant.
Energibalansen, mängden tillförd energi kontra energiproduktionen, är också avsevärt högre för sockerrörsetanol jämfört med majsetanol. För varje energienhet som läggs på majsetanolproduktion skapas 1.3 enheter. För varje energienhet som används för att producera sockerrörsetanol skapas åtta enheter. Detta ger ännu en konkurrensfördel för socker.
Det bör noteras att, när det gäller bensintillsatser, är etanolprodukter, oavsett om de kommer från socker eller majs, mycket lika från hur de reagerar i bilmotorer. När den når bilen har den förfinats till en punkt där dess ursprung är irrelevant. Den enda relevanta delen är kostnaden och energinyttan av att producera den. Oavsett om det är majs eller sockerrör, ger etanol en renare, högre oktanig bensin. Liksom biodiesel är det också en förnybar källa till bränsle.