Fostervattenprov kan erbjuda familjer och deras vårdgivare viktig information om välbefinnandet för ett utvecklande barn. Det kan hjälpa läkaren att diagnostisera genetiska störningar och bedöma om ett foster är tillräckligt moget för att överleva utanför livmodern. Denna procedur är dock inte utan risker. Komplikationer av fostervattenprov kan innefatta infektion, blödning, läckage av fostervatten, missfall och skador på fostret. I vissa fall misslyckas proceduren med att ge korrekt information om fostret.
Det största fördelen med fostervattenprov är att det ger ett prov av det genetiska materialet hos det utvecklande fostret. Denna information är avgörande för att göra en mer definitiv prenatal diagnos av genetiska syndrom. Även om ultraljud och tester gjorda på moderns blod kan tyda på tillstånd som Downs syndrom, ger fostervattenprov en mer exakt diagnos.
Fostervattenprov är också viktigt för att utvärdera kvinnor med risk för för tidig förlossning. Provet som erhålls från proceduren kan testas för att bedöma hur mogna fostrets lungor är. Omogna lungor kan tyda på att kvinnan ska försöka hålla på graviditeten så länge som möjligt för att ge sitt barn bästa chans att överleva efter födseln. Däremot kan ett test som tyder på mogna lungor förändra balansen till förmån för förlossningen av det för tidigt födda barnet.
Tyvärr finns det ett antal risker med fostervattenprov. En del av riskerna är förknippade med att fostervattenprov är ett invasivt ingrepp. Det finns alltid en risk för infektion, antingen av moderns hud eller av fostervattnet som omger fostret under utveckling. Kvinnor kan blöda för mycket som ett resultat av proceduren. Vissa kvinnor upplever ett ihållande läckage av fostervatten från platsen för nålen.
Att ha ett missfall efter fostervattenprov är en annan nackdel med proceduren. Olika forskare har uppskattat olika frekvenser av fosterförlust efter fostervattenprov. I allmänhet uppskattas risken för missfall efter proceduren vara 1.1 till 2.2 %. Detta är en ökning från en frekvens på 0.7 till 1.5 % hos jämförbara kvinnor som inte genomgick fostervattenprov. Med andra ord varierar risken för missfall i samband med proceduren från en på 300 till en på 500.
Andra risker med fostervattenprov kan ses som nackdelar med ingreppet. Nålen kan skada det utvecklande fostret, även om denna risk är sällsynt eftersom det har blivit vanligt att använda ultraljud för att styra nålen. Ibland är cellerna som erhålls i fostervattensvätskan inte representativa för den genetiska sammansättningen av fostret under utveckling, och de genetiska diagnoserna som erhålls genom att analysera dessa celler kan vara felaktiga. Proceduren är inte heller alltid framgångsrik, vilket innebär att ibland en otillräcklig mängd vätska samlas in för fullständig analys.