En låg basal kroppstemperatur är vanligtvis en avläsning under cirka 96°F (35.6°C). Temperaturen bör tas i vila, precis efter uppvaknandet, för att den ska vara korrekt. Resultatet indikerar personens ämnesomsättning, så en låg kroppstemperatur kan signalera hypotyreos, vilket ofta resulterar i biverkningar som inkluderar torr hud, depression och trötthet. För de flesta kvinnor anses detta dock vara normalt under åtminstone en del av månaden, eftersom kroppen tenderar att ha en lägre temperatur före ägglossningen som en del av det bifasiska mönstret. Detta tenderar att inträffa under menstruation – i vilket fall de typiska effekterna av låg temperatur kan sägas innefatta vaginal blödning, trötthet och humörsvängningar – även om den låga temperaturen mer är en effekt av hormonella förändringar än ett tillstånd som orsakar andra effekter.
Vissa människor håller koll på sin basala kroppstemperatur regelbundet, vanligtvis genom att använda en termometer varje morgon innan de går upp ur sängen. Att ta temperaturen vid samma tidpunkt varje dag tenderar att få de mest exakta resultaten, och de flesta läkare rekommenderar att patienter registrerar temperaturen i minst tre dagar i rad för att se ett mönster. Detta beror på att en slumpmässig låg temperatur kanske inte betyder mycket, eller så kan det vara ett resultat av en särskilt kall natt, men temperaturer som ständigt är lägre än genomsnittet kan signalera ett hälsoproblem. Till exempel, eftersom ämnesomsättningen bestäms av antalet hormoner som sköldkörteln frisätter, kan låg basal kroppstemperatur indikera hypotyreos.
En underaktiv sköldkörtel orsakar ett antal symtom, men många människor blir odiagnostiserade eftersom effekterna ofta tillskrivs andra problem. Till exempel klagar många patienter över huvudvärk, torr hud, depression, trötthet, viktökning och känslighet för kyla. Kvinnor med hypotyreos kan också märka oregelbundna menstruationscykler. Om detta tillstånd lämnas obehandlat i flera år kan patienter drabbas av långsammare tal, tjock hud och oförmåga att smaka eller lukta lika effektivt som vanligt.
För många kvinnor är dock låg basal kroppstemperatur normalt så länge det bara är ungefär halva månaden. Detta beror på att menstruationscykeln använder ett bifasiskt mönster där kroppens temperatur är låg under de första två veckorna av cykeln och högre under den andra halvan. En hög nivå av östrogen är oftast boven innan ägglossningen, varför temperaturen ökar precis efter att kroppen har ägglossning, när progesteronet tar över. Därför kan låg temperatur åtföljas av både vaginal blödning och symtom på premenstruellt syndrom (PMS), såsom trötthet, humörsvängningar och uppblåsthet.