Kronisk halsont beror vanligtvis på kontinuerlig irritation och förekommer ofta bland rökare eller de som bor i områden med hög förorening. De som använder sina röster regelbundet under långa perioder, till exempel sångare, kan också utveckla kronisk halsont om rösten inte vilas ordentligt mellan föreställningarna. Infektioner av humant immunbristvirus (HIV) kan också orsaka långvarig halsont, ofta som ett resultat av en sekundär infektion. Ytterligare orsaker kan vara allergier och sura uppstötningar.
Till skillnad från virala eller bakteriella orsaker till halsont, kan irriterande ämnen som tobaksrök eller föroreningar orsaka halsirritation som kvarstår i veckor, månader eller till och med år om irritationerna är kontinuerligt närvarande. Rökare kan utstå kronisk halsont eftersom rök och kemikalier ständigt andas in i halsen och näshålorna och irriterar de känsliga vävnaderna där. Föroreningar i luften är en annan vanlig orsak och är oftast ett problem i områden med stora mängder smog.
Att sjunga eller skrika kan också leda till kronisk halsont, och är vanligtvis längre hos dem som använder sina röster regelbundet. Detta kan inträffa hos sångare som inte värmer upp ordentligt eller som försöker för många framträdanden på kort tid. Halsirritation orsakad av ansträngning kan åtgärdas genom att avstå från att sjunga, skrika eller överdrivet prata. Ibland kan halssprayer eller honung tillsatt i varmt te också vara fördelaktigt.
HIV-infektion leder ofta till kronisk halsont, vanligtvis från trast eller annan virusinfektion. Eftersom de med hiv har försvagat immunförsvar i mer avancerade fall kan det vara svårare att bli av med infektioner som orsakar halsont. Behandling med ett receptfritt smärtstillande medel samt att ta immunförstärkande mediciner eller vitaminer kan hjälpa.
Allergier kan också orsaka kronisk halsont av många anledningar. För det första kan de leda till torra och irriterade andningsvägar när allergener andas in via munnen. Detta liknar det sätt på vilket föroreningar eller cigarettrök irriterar halsen. För det andra kan post-nasalt dropp förvärra tonsillerna och leda till svår svullnad och smärta. Allergimediciner kan hjälpa till att lindra symtomen.
Sura uppstötningar kan orsaka kronisk halsont på grund av att magsyra trycks in i halsen. I svåra fall kan detta leda till skador på matstrupen och ihållande sveda och smärta. Mediciner och ibland operation kan behövas för att lindra magsyran och stoppa smärta.