De vanligaste biverkningarna av munvatten är irritation av munslemhinnorna och en brännande känsla i munnen. Smaken av munvatten kan dröja kvar i timmar, vilket gör att maten smakar metalliskt, bittert eller kryddigt. För att lindra den brännande munbieffekten kan mer subtila smaker av munvatten användas. Ibland kan intag av stora mängder munvatten orsaka allvarligare biverkningar. Dessa inkluderar illamående och kräkningar, yrsel, diarré och yrsel.
Även om det i allmänhet inte anses vara allvarligt att av misstag svälja små mängder munvatten, kan det att medvetet dricka munvatten orsaka allvarliga biverkningar och till och med vara livshotande. Biverkningarna av munvatten kan inkludera medvetslöshet, kramper och till och med hjärtstillestånd på grund av den höga alkoholhalten som finns i vissa munvatten. Dessa biverkningar liknar de som upplevs när man dricker stora mängder alkoholhaltiga drycker.
En av de mest oroande munvattenbiverkningarna är dess potential att öka risken för svalgcancer och munhålecancer. Detta beror återigen på den höga alkoholhalten i vissa munvatten. Även om fler bevis kan behövas för att fastställa ett definitivt samband, kan det vara klokt att använda ett alkoholfritt munvatten. Andra biverkningar av munvatten inkluderar irritation och utsöndring av munvävnad, vilket är obehagligt och kan sätta scenen för en oral infektion eller till och med tandköttssjukdom.
Fördelarna med munvatten inkluderar dess förmåga att minska orala bakterier som kan leda till tandköttssjukdomar och tandinfektioner. Munvatten kan också hjälpa till att eliminera plack och dålig andedräkt. Människor som använder munvatten eller sköljmedel som innehåller fluor kan ha mindre risk att utveckla håligheter. Vissa munvatten kan också lindra halsont. Att gurgla med munvatten kan hjälpa till att lindra halsont som orsakats av en infektion, men att gurgla för ofta med ett alkoholbaserat munvatten kan bidra till ömheten.
En tandläkare bör konsulteras när munvattenbiverkningar uppstår. Han kan utvärdera munvävnadsskada och diskutera munhygien med hjälp av alkoholfria munvatten. Vissa tandläkare rekommenderar dock inte användningen av munvatten alls, utan rekommenderar istället ett bra munhygienprogram som inkluderar att borsta tänderna minst två gånger om dagen och använda tandtråd mellan måltiderna.