De stora summor pengar som växlas på aktie- och skuldkapitalmarknaderna går ofta via stora finansinstituts kanal. Dessa finansiella företag är utsatta för en stor risk för potentiella bedrägerier och andra faktorer, vilket skapar oro i hela branschen om framtiden. För vissa omger dessa farhågor potentialen för ett svar på bedrägerier från lagstiftare som utlöser för mycket reglering. Andra kan ha oro över integritetskränkningar medan andra fortfarande har blivit offer för bedrägerier.
Överreglering är ett problem för stora finansinstitut. Denna oro inkluderar en förmaning om att lagstiftare kan skapa godtyckliga regler på marknaderna för att undvika att göra någonting. En sådan tendens kan vara möjlig av tillsynsmyndigheter efter en rad händelser som visar att instabilitet och allvarliga marknadsförluster har potential att skapa en systemeffekt på ekonomin. Oron är att det som beslutas kommer att orsaka mer skada än nytta för kapitalmarknaderna och företagens vinster. Ett sätt som nyckelchefer på stora finansinstitut skyddar mot skadlig reglering är att bli en del av dialogen med tillsynsmyndigheter för att öka chansen att en förändring som sker inte är alltför skadlig.
Likviditet representerar den lätthet med vilken finansiella värdepapper och tillgångar kan konverteras till kontanter. En del av tillgångarna som innehas av stora finansinstitut är extremt illikvida, vilket kan vara ett problem för dessa företag. Det finns sätt att skydda sig mot hotet att bli oförmögen att generera likviditet. Till exempel, om ett stort finansinstitut övervakar kapital för kunder i värdepapper som anses illikvida, kan de tilldela en låsningsperiod under vilken investerare inte kan ta ut kapital. Den här funktionen kan hindra finansinstitutet från att sälja tillgångar i ett frenesi i ett försök att tillgodose kundernas krav.
Bedrägeri är ett problem för stora finansinstitut. Dessa företag är insatta i mycket känslig information som tillhör kunder. Om det sker ett säkerhetsintrång av något slag, antingen över Internet eller genom någon annan skrupelfri läcka, kan resultatet skada kunderna och företagets rykte. För att bekämpa detta spenderar stora finansinstitut stora summor pengar på dataskydd och riskhanteringssystem.
Fund of hedgefonder är investeringsinstrument som drivs av proffs som investerar i andra hedgefonder. Vissa stora finansiella institutioner driver fond av fonder, och det finns farhågor kring möjligheten att investera i något bedrägligt system. Stora åtgärder vidtas vanligtvis i due diligence och granskning för att skydda institutionen från bedrägerier, men historiskt sett har stora företag blivit utsatta för andra investeringsbedrägerier.