Resebyråavgifter inkluderar avgifter som betalas av både konsumenter och resebyråer själva. Många resebyråer tar ut avgifter från kunder för att kompensera för kostnaden för att boka reseprodukter som inte betalar någon provision samt för både tid och kostnad för att utföra reseforskning eller kommunicera med leverantörer för att ordna med speciella boenden. Utöver konsumentavgifter kan resebyråerna själva betala avgifter i form av delade provisioner med värdbyråer, medlemsavgifter för värdbyråer eller franchiseavgifter. Byråer kan också betala medlems- och kreditkortsavgifter till professionella reseorganisationer.
I de flesta fall kommer en resebyrå att tjäna huvuddelen av sin inkomst genom provisioner som betalas av leverantörer av resetjänster som hotell och kryssningsrederier. Vissa reseförsäljare betalar dock ingen provision till resebyrån om han eller hon bokar resan för sin klients räkning. Eftersom detta utgör en potentiell förlust för ombudet tar många ut resebyråavgifter av konsumenter för varje icke-uppdragsbokning som resebyrån måste göra. Till exempel, de flesta kommersiella flygbolag betalar inte längre resebyråer provisioner, så många resebyråer tar nu ut en liten serviceavgift för varje bokad flygbiljett.
Många konsumenter förväntas betala resebyråavgifter när de bokar mycket komplexa researrangemang, särskilt om arrangemangen kräver betydande forskning från resebyråns sida. Vissa resenärer väljer att besöka exotiska resmål eller planera långresor till flera olika platser. Denna typ av resor kan kräva ansträngningar från en professionell resebyrå för att fastställa visumkrav, boka kvalitetsboende och ordna lokal transport. Eftersom detta kan kräva flera timmars arbete kommer vissa resebyråer att begära att konsumenter betalar resebyråavgifter för att täcka den tid som spenderas på reseplaneringen. Dessutom kan kunder också förväntas stå för eventuella utgifter som resebyrån ådrar sig under undersöknings- och bokningsprocessen.
Resebyråer och resebyråer kan också bli skyldiga att betala olika typer av avgifter. Oberoende resebyråer arbetar ofta med en värdbyrå som tillhandahåller tekniskt stöd, tillgång till reseleverantörer och ansvarstäckning till enskilda agenter. Agenter kan betala en mängd olika avgifter till sin värdbyrå för att täcka kostnaderna för de tjänster som de får. Dessa agenter kan också behöva dela sina provisioner med värdbyrån. Byråer kan själva välja att delta i olika professionella certifieringsprogram eller dra nytta av kreditkortshanteringstjänster som erbjuds av branschorganisationer. I båda fallen kommer byrån att betala en eller flera typer av avgifter till den organisation som tillhandahåller dessa tjänster.