Peptider är stora polypeptidkedjor som består av upp till 50 aminosyror som kan klassificeras efter funktion och även genom syntes. Några vanliga typer av peptider som klassificeras efter funktion inkluderar hormoner, neuropeptider och alkaloider. När de klassificeras genom syntes kan peptider vara ribosomala, icke-ribosomala och peptoniska. Klassificeringssystemet för peptider anses vara en ofullständig vetenskap eftersom en peptid kan tillhöra flera grupper samtidigt och forskare fortsätter att diskutera när en peptid ska klassificeras som ett protein, eller ett protein som en peptid. Många forskare är överens om att en peptid inte lätt överensstämmer med ett specifikt mönster, medan ett protein är mer distinkt i naturen till konformation.
Hormoner, en av de vanligaste klassificeringarna av peptider i människokroppen, är specifika budbärarmolekyler som används i cellulär kommunikation. Hormoner identifieras som sådana eftersom de utsöndras och syntetiseras av specialiserade grupper av celler, kallade endokrina körtlar. Efter utsöndring reser hormonpeptider till målorgan där de verkar. Ett hormons form är specifikt relaterad till receptorer på motsvarande målorgans cellmembran. Till exempel har hormonpeptiderna glukagon och insulin specifika receptorställen i levern som hjälper dem att kontrollera blodsockernivåerna.
Neuropeptider är utbredda i kroppens centrala och perifera nervsystem och har specifika hämmande och excitatoriska funktioner. Neuropeptider fungerar på ungefär samma sätt som signalsubstanser som serotonin och dopamin. En av de mest välkända klassen av neuropeptider är endorfiner. Endorfiner ses som kroppens endogena smärtstillande medel, ofta jämfört med läkemedlet morfin.
En del av endorfinernas funktion inkluderar hämning av en annan neuropeptid, Substans P, som överför smärtsignaler från det perifera nervsystemet till mottagare i det centrala nervsystemet. Ibland kan neuropeptider också fungera som hormoner i vissa system i kroppen.
När det gäller klassificeringen av peptider på grund av deras syntes, är de flesta ribosomala; denna peptidtyp syntetiseras när budbärarribonukleinsyran (mRNA) på cellen översätts. Under translation sker en kemisk process där en karboxylgrupp på en aminosyra kopplas ihop med en annan aminosyra för att skapa början av en aminosyrakedja. Ribosomala peptider består ofta av 30 till 40 aminosyror sammanfogade. Den icke-ribosomala typen av peptid syntetiseras när det finns enzymatiska katalysatorer närvarande. Peptoniska peptider är sällsynta och bildas under matsmältningsprocesser i kroppen.