De olika typerna av hydronefrosbehandling beror i allmänhet på platsen för hindret, eftersom det initiala målet är att tömma eventuell urin som fastnat. När urinen har tagits bort växlar behandlingens fokus till att säkerställa att problemet inte återkommer. Hydronefrosbehandling börjar vanligtvis med att antingen en kateter eller slang förs in i kroppen för att dränera vätskan. När detta har slutförts behöver blockeringen ofta tas bort, vanligtvis genom operation.
Att ta bort eventuell instängd urin och lätta på trycket på njuren är det primära målet med hydronefrosbehandling, eftersom detta är viktigt för att förhindra njurskador. Ofta uppnås detta genom en kateter som förs in i urinblåsan. Behandling för en ansamling av urin inkluderar ibland införandet av mjuka rör direkt i njuren. I de flesta fall kommer en blockering i de övre urinvägarna att kräva en slang medan en blockering i den nedre delen kräver en kateter.
Att tömma urin inifrån njuren är en viktig del av hydronefrosbehandling, men det löser inte det underliggande problemet. Blockeringen behöver vanligtvis tas bort, annars kommer urinen att byggas upp igen med tiden. Inte alla fall kräver operation, men de flesta gör det.
Liksom med dräneringsprocessen beror typen av operation för hydronefros på platsen för blockeringen. Hydronefrosbehandling för att eliminera blockeringen är dock väsentlig; om det lämnas under en längre tid kan tillståndet orsaka bestående njurskador. Tidigare användes öppen eller laparoskopisk kirurgi, men endoskopisk kirurgi är nu vanligare för detta tillstånd och är vanligtvis mindre invasiv.
Om blockeringen orsakas av en förträngning av urinledaren, som är ett rör som transporterar urin till urinblåsan, kan operation för att ta bort detta avsnitt behövas. Om tillståndet orsakas av en sten i njuren, krävs också ofta borttagning. Många människor återhämtar sig helt från hydronefroskirurgi, så länge tillståndet upptäcks relativt tidigt.
Den korrekta behandlingen beror också på tillståndets svårighetsgrad och om det är kroniskt eller akut. Om tillståndet är kroniskt, vilket innebär att det byggs upp långsamt, är behandlingen vanligtvis inte akut, utan kommer att behöva inträffa i något skede. Om symtomen är mer akuta kan dränering av urinen behöva utföras snabbare för att förhindra långvariga skador på njurarna.