Bakteriedetektering är viktigt i många industrier för att skydda mat, luft och vatten från kontaminering eller för att identifiera infektionskällan i en medicinsk miljö. Traditionella metoder för bakterieupptäckt, som kulturinsamling, är effektiva men det kan ta timmar eller dagar att visa resultat och kan missa de flesta typer av bakterier. Det finns nyare, snabbare metoder för bakteriedetektering som utvecklas för att effektivisera processen och öka detektionshastigheten. Några av dessa inkluderar polymeraskedjereaktion (PCR), infraröda enheter som upptäcker bakterier i mat och snabba skanningar som upptäcker bakteriell kontaminering i blodplättar. Många av dessa metoder upptäcker bakterier genom att mäta syrenivåer eller minimala elektriska störningar som indikerar närvaron av bakterier.
Den traditionella tekniken för bakterieupptäckt är att ta ett prov, odla en bakteriekultur och räkna de bakterier som växer. Denna metod används ofta i medicinska miljöer som innehåller blodplättsprodukter. Eftersom trombocytprodukter måste förvaras i rumstemperatur löper de en hög risk för bakteriell kontaminering.
Traditionella odlingstekniker upptäcker förändringar i syrenivåer som indikerar närvaron av bakterier, men resultaten kan ta sju dagar. Det finns nyare, snabbare system för att upptäcka bakterier, som fastfascytometri, som detekterar och räknar alla fluorescensmärkta bakterier inom tre minuter.
Liksom metoderna som används för att upptäcka bakterier i trombocytprodukter kräver bakterieupptäckt i vatten eller luft typiskt blodplättsantal, där vatten placeras på en agaryta och en kultur tillåts växa. Efter tillräckligt med tid för att tillåta bakterier att föröka sig, räknas bakteriekolonier. Ett annat sätt att identifiera bakterier i vatten är att använda ett virus för att infektera bakterier med fluorescerande reportermolekyler som kan identifieras med fluorescensspektroskopi.
En nyare metod för bakteriell detektion som har potential för ett brett spektrum av tillämpningar är en sensor som är belagd med bakteriella antikroppar som har en elektrisk ström passerad genom sig. När denna sensor kommer i kontakt med bakterier, upptäcker sensorn förändringar i frekvensen som indikerar bakteriell närvaro. Denna teknologi har använts för att förbättra upptäckten av Escherichia coli (E. coli) bakterier i köttbearbetningsanläggningar samt för att detektera mikrocystin-LR (MC-LR) toxin i dricksvatten. Denna teknik upptäcker bakterier på några minuter, medan den äldre odlingsmetoden tar timmar till dagar.
PCR är en molekylär teknik för bakteriell identifiering som har flera fördelar jämfört med andra metoder för bakteriell detektion. Vissa uppskattningar säger att mer än 99 procent av alla bakterier i människokroppen inte kan odlas, vilket gör traditionella tekniker otillräckliga för många tillämpningar. PCR kan detektera låga mängder bakterier mycket snabbt med hjälp av RNA- och DNA-förstärkningstekniker.