Webbfiltrering med öppen källkod används i många företag och skolor för att blockera olämpliga eller tidsödande webbplatser, så att elever och anställda kan koncentrera sig på att lära och arbeta. Administratörer bör alltid kontrollera licensen för öppen källkod som följer med ett webbfiltreringsprogram med öppen källkod, eftersom många föreskriver att kommersiell eller affärsanvändning är förbjuden. När administratörer uppdaterar programmets svarta listor bör de vara extra uppmärksamma på att hitta proxywebbplatser, eftersom många använder dessa för att smyga runt filter. Även om webbfilter ska blockera skadliga eller onödiga webbplatser, blockerar de ibland för mycket, så administratörer bör också fokusera på att utveckla en vitlista. Webbfilter levereras vanligtvis med en förinstallerad lista över blockerade webbplatser, men vissa användare kan hitta en webbplats som borde på listan, men som inte är det; För att undvika problem som härrör från detta bör administratörer skanna historikrapporter och lägga till nya webbplatser till den svarta listan vid behov.
De flesta webbfiltreringsprogram med öppen källkod används i företag, men detta kan vara ett problem. Många licenser för öppen källkod tillåter inte kommersiell eller affärsmässig användning av webbfiltret, vilket innebär att företaget kan hamna i en rättegång om användningen upptäcks. För att undvika denna möjlighet bör administratörer läsa licensavtalet noggrant innan de distribuerar filtret över ett nätverk.
När ett webbfilter är på plats, uppmanas det att lägga begränsningar på datorer med vissa IP-adresser (Internet Protocol). Om en användare kan ändra sin IP-adress genom att använda en proxy, undviker han eller hon effektivt alla begränsningar för webbfiltrering med öppen källkod. Många webbfilter uppdaterar snabbt och automatiskt sin svartlista för proxywebbplatser, men administratörer bör hålla utkik efter nya proxywebbplatser och se till att de finns på listan.
Webbfilter gör ibland sitt jobb för bra och blockerar en webbplats som inte är skadlig eller olämplig; ännu värre, de kan blockera en webbplats som är nödvändig för att användarna ska kunna utföra sitt arbete. Denna möjlighet innebär att administratörer bör utveckla en vitlista för webbfiltrering med öppen källkod. Vitlistan, i motsats till den svarta listan, är en lista över webbplatser som kan nås av användare, även om webbplatserna normalt skulle vara blockerade.
Ett webbfiltreringsprogram med öppen källkod kommer vanligtvis packat med miljontals begränsade webbplatser, och det är ovanligt att en användare snubblar på en webbplats som borde blockeras men inte är det. Samtidigt bör administratörer gå igenom nätverkshistorikrapporter, bara för att kontrollera att eventuella olämpliga webbplatser används. Om några webbplatser hittas bör de läggas till i webbfiltrets svarta lista.