En skäggdrakehona har bara en egenskap som definitivt kan skilja henne från en skäggdrakehane genom utseende. Det mest bestämda kännetecknet för en kvinnlig skäggdrake är avsaknaden av en hemipenal utbuktning, medan den manliga skäggiga draken kommer att ha två halvpendelformade utbuktningar. Denna egenskap hos kön är dock vanligtvis inte synlig hos unga drakar och unga drakar, även om det blir lättare att bestämma kön hos vuxna skäggiga drakar.
De hemipenala utbuktningarna är belägna under den manliga skäggiga drakens svans, ovanför den ventrala öppningen. Hos män kommer hemipenala utbuktningar att vara synliga på båda sidor av svansen. Honan saknar hemipener, men det kommer att finnas en liten utbuktning i mitten av svansen ovanför den ventrala öppningen. Även om detta är den enda egenskapen för att med säkerhet avgöra könet på en skäggig drake, finns det andra allmänna egenskaper som är vanligare hos män än hos kvinnor, och vice versa.
En av skäggiga drakars egenskaper är deras förmåga att blåsa ut skägget och göra skägget mörkt. Kvinnor kan göra detta också som män, men män uppvisar i allmänhet detta beteende oftare än kvinnor, och mäns skägg blir vanligtvis mörkare i färgen än skägget hos drakar. Draken blåser ut skägget och gör det mörkt som en del av uppvaktningsrutinerna, när den skäggiga draken känner ett behov av att försvara sitt territorium eller när den skäggiga draken känner sig hotad.
Storlekar på skäggiga drakar är inte ett kännetecken för kön, även om den kvinnliga skäggdraken i allmänhet kommer att ha ett mindre huvud än hennes manliga motsvarigheter. Hanar har ofta tjockare svansar än honor, även om detta inte kan användas för att bestämma kön. En skäggig drakes svans tjocknar när den åldras, så en äldre skäggdrakehona kan ha en tjockare berättelse än en yngre skäggdrakehane.
I många fall visar kvinnliga skäggdrakar ett mindre aggressivt beteende än skäggdrakar, men som med andra egenskaper är detta inte alltid sant. Skäggiga drakar når sexuell mognad så unga som åtta månader. Kvinnliga skäggiga drakar kommer att gräva och försöka skapa hålor där de kan lägga sina ägg. Även om en skäggig drakehona inte parar sig, kan hon fortfarande lägga ägg, med cirka 20 ägg i en koppling. En manlig skäggdrake kan dock också ses gräva hålor, eftersom vissa skäggdrakar också gräver hålor för att sova och under tider av stress.