Under hypnos rapporterar människor rutinmässigt känslor av lugn och avslappning, såväl som en minskad känsla av smärta. Genom användning av hjärnavbildning har forskare noterat att hjärnans prefrontala cortex, som hanterar aktiviteter som fokuserad uppmärksamhet och beslutsfattande, visar en tydlig förändring i sina vanliga mönster när en person genomgår hypnos. Dessa förändringar bekräftar att mindre smärta faktiskt upplevs och inte bara föreställs, och att medvetenheten faktiskt ökar när en persons medvetande förändras av hypnos.
När sinnet är under hypnos, antas det ofta att människor sover och saknar kontroll över sitt beteende. I själva verket är det tvärtom. Under hypnos är den kognitiva delen av hjärnan som vanligtvis handlar om logik och tänkande mer aktiv än den är i ett icke-hypnotiskt tillstånd. Det är när en person är under hypnos som den tänkande delen av hjärnan faktiskt är starkare och därmed bättre kan motstå beroendeframkallande beteenden eller att uthärda smärta utan att bli överväldigad av det.
Hypnosterapi används ofta för att behandla ångest och stressrelaterade sjukdomar som Crohns sjukdom och irritabel tarm. Forskning stödjer att hypnosterapi är framgångsrik för att minska symtom på sådana sjukdomar eftersom de mentala effekterna av hypnos resulterar i djupare avslappning. Efter att ha placerats under hypnos upplever människor också fysisk lindring av symtom som ofta orsakas av stress, såsom mag-tarmproblem, huvudvärk, sömnlöshet och trötthet.
Under hypnos är en person särskilt lugnare, men genom kraften av hypnotiska förslag kan effekterna av hypnos också hjälpa en person efter att en hypnoterapisession har avslutats. Till exempel, under hypnos, kan förslag ges för en person att andas djupt när han ställs inför stress i framtiden eller för att bli mer medveten om hur kroppen mår när han ställs inför ångest. Genom att skapa en ökad posthypnotisk medvetenhet kan en person sedan arbeta för att motverka negativa reaktioner genom att avsiktligt slappna av i kroppens muskler och ta några renande andetag istället för att hamna i en okontrollerad känslomässig reaktion när den står inför framtida stressiga situationer.
Fördelarna upplevs inte bara när de placeras under hypnos av en hypnosterapeut, utan forskning visar att samma reaktioner också kan åstadkommas av självhypnos. De känslomässiga effekterna av hypnos har till och med visat sig vara ganska fördelaktiga för kvinnor som genomgår en bröstbiopsi, såväl som för att hantera smärta efter en sådan procedur. Ångest följer ofta bröstbiopsiprocessen, som innebär att en del av bröstvävnaden skärs bort för undersökning. Ångest känns också på grund av möjligheten att få en cancerdiagnos. Forskning har dock visat att kvinnor som förleds att engagera sig i självhypnos är mindre benägna att uppleva höga ångestnivåer relaterade till denna procedur.