En kvinnas basala kroppstemperatur under graviditeten förblir något förhöjd från tidpunkten för befruktningen till ungefär slutet av första trimestern. I de flesta fall är denna lilla ökning av vilotemperaturen inte märkbar förutom med användning av en basaltermometer, som exakt kan avläsa kroppstemperaturen till 0.1°F (0.18°C). Många kvinnor använder de små fluktuationerna i basal kroppstemperatur för att avgöra när de är mest fertila och då som en tidig indikator på graviditet.
Även om det finns normala fluktuationer i basal kroppstemperatur, är den under graviditeten i allmänhet mellan 0.4 och 1.0 °F (0.072 och 0.18 °C) högre än mellan en kvinnas mens och tidpunkten för hennes ägglossning. Om en kvinnas basala kroppstemperatur förblir förhöjd i mer än 15 dagar eller så efter ägglossningen, kan detta vara en tidig indikation på att hon är gravid. Falskt negativ är inte ovanligt med graviditetstest, men en stabil, något förhöjd temperatur från den senaste ägglossningen under två eller flera veckor är en stark indikator på att kvinnan har blivit gravid. Under denna tid är graviditetstester ofta opålitliga, så många kvinnor använder denna temperatur för att avgöra om de kan vara gravida eller inte.
Den basala kroppstemperaturen kommer att förbli på denna något förhöjda nivå under den första trimestern av en normal graviditet. I slutet av första trimestern återgår kvinnans temperatur till det normala. En kraftig ökning är förmodligen en indikation på att hon bekämpar en infektion eller sjukdom.
Många kvinnor använder basal kroppstemperatur för att hjälpa dem att fastställa sina fertilitetscykler. Temperaturen är vanligtvis ganska konsekvent mellan slutet av en kvinnas mens och hennes nästa ägglossning. När en kvinna har ägglossning kommer hennes basala kroppstemperatur att sjunka några tiondels grader och sedan stiga kraftigt, mellan 0.4 och 1°F (0.072 och 0.18°C). Temperaturen kommer att förbli förhöjd tills kvinnan börjar sin mens, då cykeln börjar om igen. Om en kvinna har blivit gravid bör hennes kroppstemperatur förbli förhöjd, så en minskning av denna temperatur är en stark indikator på att hon inte har blivit gravid under en given ägglossningscykel.