En flottans flygledare ansvarar för att styra och kontrollera flygtrafiken i närheten av ett hangarfartyg eller flottbas. Vanligtvis upprättar en marinflygledare endast radiokontakt med militära piloter, även om flygledare kan försöka få kontakt med civila piloter som går in i sjöflygrummet. Liksom civila kontrollanter måste en militär kontrollant avlägga en högskoleexamen och genomgå omfattande utbildning på jobbet.
Sjöstyrkor i många länder använder hangarfartyg för att färja militärjetplan och andra flygplan till olika platser runt om i världen. Piloter använder dessa farkoster och dessa individer är ansvariga för att avlyssna fiendejaktare och utföra spaningsuppdrag. Eftersom marinpiloter ofta utför uppdrag i avlägsna havsområden behövs flygledare ombord för att styra flödet av flygtrafik och för att säkerställa att inga kollisioner i luften inträffar. Dessutom är många sjöoperationer topphemliga i vilket fall militären tenderar att använda sjöflygledare snarare än civila kontrollanter även om sjöpiloter opererar inom kommersiellt luftrum.
Hangarfartyg är ständigt i rörelse, vilket innebär att piloter förlitar sig på flygledare för att guida dem till dessa fartyg efter att uppdragen har slutförts. Jämfört med flygfält har marinfregatter relativt lite manöverutrymme vilket gör att flygledare måste se till att däck är fria innan piloter kan ges tillstånd att landa. Som med civila flygledare måste en flottans flygledare också ta hänsyn till väderförhållandena innan piloterna får tillstånd att starta eller landa sjöflygplan.
Under konfliktsituationer kommer en marinflygledare att övervaka luftrummet runt ett fartyg eller en marinbas för att hålla reda på fiendens stridsflygplan som kan utgöra ett hot mot marinstyrkorna. Flygledaren måste varna sjöpiloter om sådana hot. Typiskt tilldelas en flygledare till varje hangarfartyg; flygledare på fartyg som verkar i samma vatten måste ha kontakt med varandra för att säkerställa att planen från deras fartyg inte kolliderar. Under vissa omständigheter kan marinkontrollanter också komma i kontakt med flygvapnets piloter om andra militära enheter tillhandahåller luftskydd till marinfregatter.
I allmänhet måste en marinflygledare slutföra en fyraårig examen i flygteknik eller ett liknande ämne. Precis som med andra medlemmar av de väpnade tjänsterna måste kontrollanter framgångsrikt klara grundläggande utbildning och i många fall måste dessa individer tillbringa flera månader eller år vid marin utbildningsakademier innan de ansöker om kontrolljobb. Normalt är det bara officerare som kan söka till controllertjänster.