En industriell mikrobiolog, ibland kallad bioteknolog, använder mikroskopiska organismer vid produktion och tillverkning av säljbara produkter för kommersiellt bruk. Denna position används i skapandet av många vanliga hushållsartiklar, som rengöringsmedel, antibiotika och livsmedelsprodukter. Arbetskraven varierar beroende på anställningsbranschen och kan kräva att anställda utför forskning och utvecklar nya produkter med hjälp av mikrobiell teknik. Mikrobiologer är anställda av alla aspekter av livsmedelsindustrin, läkemedelsföretag och avfallsbehandlingssystem.
Organismer som vanligtvis används i denna typ av tillverkning är svampar, virus, protozoer, bakterier och alger. Dessa mikrober kan användas för att bryta ner större organiska material och syntetisera nya föreningar genom sin naturliga förmåga att initiera nya kemiska reaktioner i de material som de interagerar med. En industriell mikrobiolog är utbildad att konstruera dessa reaktioner i en kontrollerad miljö för olika ändamål. Han kan också vara intresserad av att skydda produkter mot invasion av dessa organismer. Till exempel är antibakteriella produkter och konserveringsmedel utformade för att förhindra tillväxt av bakterier på ytor och i vissa livsmedel.
Branscher som anställer en industriell mikrobiolog inkluderar bland annat avfallshantering, bryggerier, bagerier och läkemedel. Alger och bakterier livnär sig naturligt på organisk avföring och förs ofta in i avfallsreningsverk för att rena vattnet och bryta ner större mängder avfall. Jäst är den mikroskopiska livsform som är ansvarig för jäsningsprocessen som skapar ölets alkoholhalt och mycket av dess smak. Denna hushållsorganism är också anledningen till att bröd, frallor och deg jäser när de får sitta och värmas. Olika typer av antibiotika skapas genom jäsningsprocessen av de mikroorganismer som kallas actinomycetes.
Dessa bioteknologer är nyckeln i produktionen av de flesta vacciner. Ett vaccin skapas vanligtvis genom att isolera vissa delar av viralt DNA och injicera dem i en frisk individ. Kroppens immunsystem analyserar det främmande DNA:t och börjar tillverka antikroppar som kommer att förstöra det. När den vaccinerade patienten till slut stöter på virusets fulla form, genom potentiell exponering för en infekterad person, är hans kropp redan beredd att bekämpa sjukdomen. Till exempel ändras virusstammen av influensa säsongsmässigt, och ett nytt vaccin måste skapas regelbundet för att bekämpa varje ny stam eftersom den infekterar den allmänna befolkningen.
En industriell mikrobiolog kan ansvara för forskning, produkttester, kvalitetskontroll, produktutveckling och genteknik. Denna karriärväg kräver slutförandet av en eftergymnasial examen med klasser som fokuserar på biologi, mikrobiologi och biokemi. Vissa arbetsplatser kräver också att sökande har en magisterexamen i mikrobiologi, även om detta inte är en branschstandard.