Vetenskaplig medicin avser en typ av medicin som utvecklats under de senaste århundradena och blev vad vi nu känner som konventionell medicin från 19-talet och framåt. Modern medicin, som den också kallas, är beroende av vetenskapliga observationer för behandling och förståelse av människokroppen. Upptäckten av bakterieteorin och de smittsamma orsakerna till sjukdomar var ett viktigt genombrott för den vetenskapliga medicinen. Före etableringen av den vetenskapliga medicinen var en mängd olika metoder för medicin på modet, som blödning och utrensning, men med tillkomsten av evidensbaserade behandlingar föll dessa i onåd. Centralt för den vetenskapliga medicinen var utbildning och kvalificering av läkare till vetenskaplig standard.
Teknologiska framsteg inom medicinområdet under 19-talet bidrog i hög grad till förståelsen av sjukdomar i människokroppen. Mikroskop gjorde det möjligt för forskare att identifiera och beskriva celler och ta reda på vilka celler som var onormala vid sjukdom. Utrustning som fortfarande används idag i någon form, såsom stetoskop och röntgenapparater, uppfanns. Farmakologi, studier och produktion av läkemedel, blev mer kommersiellt gångbar än tidigare på grund av nya kemiska syntes- och förädlingsprocesser under den industriella revolutionen.
Laboratorietekniker, såsom mikroskopisk analys och kemiska tester av ämnen som urin, blev också användbara för läkare under denna tid. Fysiologi, som är studiet av hur kroppen fungerar, hjälpte också denna process. Bakterieteorin, som erkände de mikroskopiska organismerna som orsakade infektionssjukdomar, är en annan viktig del av det vetenskapliga medicinska tillvägagångssättet. Läkarna blev också mer intresserade av experimentell medicin och dokumenterade sina försök och resultatet för andra läkare.
Ett system för att kontrollera effektiviteten av en viss behandling, kallat den numeriska metoden, utvecklades också under 19-talet. Resultat av specifika behandlingar kunde analyseras genom statistik och en läkare kunde sedan se om en behandling var användbar, värdelös eller farlig. Denna metod för att kontrollera evidensen, som är väsentlig för modern klinisk forskning, innebar att tidigare vanliga behandlingsalternativ såsom blodutsläpp kasserades och ersattes med behandlingar som en läkare kunde visa effektivitet för.
Även om dessa framsteg mot vetenskaplig medicin pågick under 19-talet, fanns det ingen enskild utbildningskvalifikation i enskilda länder som kunde producera läkare som arbetade enligt evidensbaserad medicin. Professionella organisationer av läkare som trodde på vetenskaplig medicin framför andra typer av medicin lobbat för att personer som praktiserade som läkare skulle ha en examen. Statliga myndigheter i länder som prenumererade på den vetenskapliga metoden skapade medicinska licensieringsnämnder och gav godkännande endast till de utbildningsinstitutioner som kunde tillhandahålla den nödvändiga standarden för utbildning och examen till studenter.
Standardisering innebar att människor som praktiserade en mindre rigoröst evidensbaserad medicin inte kunde kalla sig läkare eller praktisera som läkare. I modern tid är vetenskaplig medicin även känd som konventionell medicin. Sjukvårdsbranschen för komplementär och alternativ medicin (CAM) använder inte nödvändigtvis samma regler som den vetenskapliga metoden, och kanske inte har samma evidensbaserade inställning till medicin.