Att definiera strukturell ekonometri är vanligtvis bäst när man först förstår båda termerna individuellt i ekonomisammanhang. Termen ekonometri betyder vanligtvis sammansmältningen av ekonomisk teori och statistiska metoder vid analys av data. Strukturell hänvisar vanligtvis till uppskattning, vilket betyder den avsiktliga tillämpningen av ekonomisk teori vid modellering av empiriska studier. Strukturell ekonometri definieras således ofta som empiriska studier som inbegriper ekonomisk teori för modellering och analys av resultaten. Vissa ekonomer finner metoden användbar för att dra koncisa slutsatser mellan samband och ekonomiska, statistiska och institutionella antaganden.
Strukturell modellering kan variera med tanke på när ett forskningsprojekt utformas. Forskare har stor flexibilitet när det gäller att avgöra hur mycket ekonomisk teori som ska inkorporeras i design och analys. De har också en stor flexibilitet när det gäller att avgöra hur mycket de ska förlita sig på statistiska antaganden, och denna slutgiltiga användbarhet av metoden är vanligtvis baserad på kompromisser. Oenighet om vilka val som finns och i vilka situationer man väljer dessa val är rutin, samtidigt som man ofta diskuterar kompromisser som görs om forskningsprojekt eftersom det inte finns några konkreta regler. Ändå verkar fokusering på strukturell ekonometri erbjuda några tydliga fördelar.
Implicit resulterar i kopplingen av statistiska modeller och ekonomisk teori i icke-strukturella tillvägagångssätt, med ekonomisk teori ofta inte ens närvarande i ekonometrikurser på college. Det är uttryckligen målet med det strukturella tillvägagångssättet, att locka forskare att skapa kopplingar mellan ekonomi, statistik och den verkliga världen. Därför ger strukturell ekonometri potentiellt några distinkta fördelar.
Att uppskatta strukturella parametrar är en sådan fördel, samtidigt som det tillåter användning av räknarexperiment, simuleringar och jämförelse av statistik. Det möjliggör också jämförelse av olika teorier som tillämpas på ett forskningsprojekt, medan explicita antaganden också kommer att ge djupare insikter om de mekanismer som påverkar resultaten. Tillämpning av strukturell ekonometri används ofta i spelteoriprojekt för att förstå utbud och efterfrågan på marknaden samt en mängd andra forskningsinsatser där explicita resultat är till hjälp snarare än ett hinder.
Icke-strukturella tillvägagångssätt gör dock en av tre saker: förlita sig på statistik kommer lite eller ingen input från ekonomisk teori, förlita sig på ekonomisk teori med liten eller ingen input från statistik eller innehåller en minimal fusion av de två. Exempel på icke-strukturella studier inkluderar prognoser, som förlitar sig på statistik och mätstudier som BNP, som bygger på ekonomisk teori. Politisk utvärdering ingjuter både ekonomisk teori och statistik genom att uppskatta tillfälliga effekter, men anses inte vara strukturell ekonometri eftersom den vanligtvis gör minimala antaganden . Ur en konceptuell synvinkel innebär detta att icke-strukturellt och strukturellt arbete är fundamentalt olika, men inte alltid i tillämpningen eftersom linjerna suddas ut avsevärt.