Skillnaden mellan syntax och morfologi är att syntax handlar om strukturen av meningar och morfologi handlar om strukturen av ord. På alla språk finns det regler som styr hur ord sätts ihop. Detta är reglerna för syntax. Morfologi är studiet av hur ord bildas och förstås inom ett språk. Både syntax och morfologi är relaterade till hur mening skapas med språk.
Syntax är ett begrepp som styr strukturen av meningar. Ordningsföljden i vilken orden sätts ihop har betydelse för meningen i en mening som helhet. Syntaxregler måste följas för att en mening ska vara grammatiskt korrekt och vara meningsfull för talare av ett språk. Det är vad som dikterar saker som ordningen på subjektet och verbet, och hur adjektiv och adverb används.
Morfologi är studiet av morfem, som är den minsta betydelseenheten i ett språk. Ett morfem kan vara ett helt ord eller ett prefix eller suffix som förstås ändra ordets innebörd och därför får betydelse själv. Morfologi inkluderar begreppen böjning och avledning, som gör att ord kan göras i plural eller för att ändra ett ords tid. Studiet av morfologi försöker förstå hur människor använder och förstår hur ord fungerar, i ett försök att förstå skillnaden som ett morfem gör för många ord och hur ord relaterar till varandra.
Syntax och morfologi är båda viktiga för det sätt som människor hämtar mening från språket, men de är olika genom att syntax hänvisar till ordningen och användningen av ord, och morfologi hänvisar till de delar av ord som skapar mening. Det är till exempel möjligt att skapa en mening som är grammatiskt korrekt, men som inte är meningsfull för en talare av språket. Detta är möjligt eftersom syntaxen bara styr ordningen på en mening och inte vad orden i den betyder. Å andra sidan kan en kombination av ord vara meningsfull när de används tillsammans, men förlora sin betydelse när de ordnas om på ett sätt som bryter mot syntaxreglerna. Syntax och morfologi är olika men är beroende av varandra.