Även om både loratadin och cetirizin är typer av antihistaminer, är de var och en olika kemisk förening som behandlar symptomen på allergier på olika sätt. Båda dessa läkemedel ges för samma typer av allergier, och de är båda effektiva mot nysningar, näsklåda och rinnande ögon och ineffektiva mot symtom som nässelfeber och systemiska allergiska reaktioner. Trots likheterna i effekterna av dessa läkemedel är deras kemiska sammansättning olika och som ett resultat har de olika effekter på patienter som tar dem.
Molekylärt är dessa ämnen uppbyggda på olika sätt. Loratadin består av 22 kolatomer, 23 väteatomer, två kväveatomer, två syreatomer och en kloratom. Dessa atomer är ordnade i en molekyl som har ett antal olika grenar. Cetirizin består av 21 kolatomer, 25 väteatomer, tre syreatomer, två kväveatomer och en kloratom som är ordnade i en lång kedja och kopplade till två hydrokloridmolekyler. Även om byggstenarna är lika, tillåter arrangemanget av dessa molekyler dem att bekämpa allergisymptom på olika sätt.
En av de största skillnaderna mellan loratadin och cetirizin är de typer av biverkningar som patienter kan uppleva när de tar dem. Medan muntorrhet och gastrointestinala obehag ses vid användning av båda dessa mediciner, är loratadin också känt för att orsaka huvudvärk, munsår, nervositet och rastlöshet. Cetirizin, å andra sidan, kan orsaka dåsighet som kan vara allvarlig hos vissa patienter. Det är också möjligt för patienter som tar cetirizin att få andningssvårigheter, en biverkning som vanligtvis inte ses hos patienter som tar loratadin om inte patienten går in i anafylaxi.
En annan skillnad mellan loratadin och cetirizin är hur varje läkemedel kan administreras. Vuxna får vanligtvis en dos på 10 milligram en gång per dag av någon av dessa mediciner, medan barn över två år ofta får hälften av den mängden. Det finns ingen fastställd dos av loratadin för barn yngre än två, medan barn mellan sex månader och två år säkert kan ta 2.5 milligram cetirizin.
Långtidseffekterna av höga doser loratadin och cetirizin är också olika. I laboratorietester ökade inte cetirizin risken för cancer eller minskade fertiliteten, även om det gavs i doser långt över den rekommenderade maximala dosen. Extremt höga doser av loratadin ledde dock till en ökad cancerrisk, såväl som en minskning av manlig fertilitet.