Kopplingen mellan urin- och reproduktionssystemen ligger i den tidiga fosterutvecklingen av dessa system och systemens anatomiska placeringar. Urin- och reproduktionssystemen hos människor skapas från samma embryonala lager under fosterutvecklingen. Under den första trimestern av fostrets mognad, differentierar dessa två system sig till att bli två separata kroppsfunktioner. Urinvägarna utvecklas till ett system av kroppsfunktioner för att ta bort avfall, och reproduktionssystemet utvecklas till ett system av kroppsfunktioner med det enda syftet att föreviga arten.
Urin- och reproduktionssystemen utvecklas från det mellanliggande mesodermskiktet. Från detta lager utvecklas njurarna, könskörtlarna, Wolffian-kanalerna och Müllerian-kanalerna. Wolffian kanalerna atrofi hos honor men fortsätter att utveckla sädesblåsor, sädesledaren, epididymis och ejakulationskanalen hos män. De Mülleriska kanalerna bildas i livmodern, äggledarna och slidan hos kvinnor. Könskörtlarna blir testiklarna hos män och äggstockarna hos kvinnor.
Senare i utvecklingen, efter att njurarna har stigit på plats, bildas blåsan från delar av Wolffian-kanalerna och endodermal cloaca. Urinröret bildas helt hos honor och delvis bildat hos män från endodermal kloak. Resten av det manliga urinröret utvecklas från de yttre könsorganen.
Hos män överlappar urin- och reproduktionssystemen något. Urinröret hos män har ett dubbelt syfte för både eliminering av urin och utlösning av spermier. Urin bildas i njurarna som ett avfallsmaterial och färdas ner genom urinledarna till urinblåsan för lagring tills det elimineras från kroppen. Vid tidpunkten för urinering strömmar urinen från urinblåsan genom urinröret och lämnar kroppen från penis.
Könskörtlarna hos män kallas testiklarna. Spermier utvecklas i testiklarna och lagras i epididymis spolar. Innan utlösning färdas spermier från lagring i bitestikeln genom sädesledaren, som ligger precis bakom urinblåsan och ansluter till urinröret. Spermierna ejakuleras sedan från kroppen via urinröret genom änden av penis.
För kvinnor är urin- och fortplantningssystemet separerade, även om både urinröret och slidöppningen är belägna inom blygdläpparna i slidan. Precis som hos män produceras urin i njurarna och går till urinblåsan via urinledarna. Urin släpps ut från honan genom urinröret, som är beläget framför slidöppningen inrymd i blygdläpparna.
Ägg produceras i de kvinnliga gonaderna, eller äggstockarna. Vanligtvis kommer ett enda ägg att resa från äggstockarna in i äggledarna och slutligen till livmodern. Om befruktning av ägget inte inträffar kommer mens, vilket gör att livmoderns livmoderslemhinna och det obefruktade ägget kan släppas ut genom livmoderhalsen, in i slidan och ut i kroppen genom slidöppningen.