Amygdala är en struktur i hjärnan som vanligtvis förknippas med känslomässiga tillstånd. Det finns dock ett starkt samband mellan amygdala och minne. I kombination med andra delar av det limbiska systemet, såsom hippocampus, hjälper denna del av hjärnan att reglera och koda känslomässiga minnen. Framtida beteende dikteras ofta av känslomässigt minne. Att associera en känsla som rädsla med en viss händelse kan hjälpa en att reagera på farliga stimuli, eller en känsla av njutning med en viss mat kan hjälpa dig att vägleda framtida kostval.
Det finns två konkurrerande teorier om hur amygdala hjälper känslomässigt minne att bildas. Amygdala kan direkt koda det känslomässiga minnet i viss utsträckning, och arbetar med hippocampus. Alternativt kan det ge input för minnesbehandling som utförs av hippocampus. Vissa forskare har till och med föreslagit en flytande integration av dessa teorier, där regleringen av känslor och minne faktiskt kan ske med hjälp av aktivitet i båda dessa strukturer. Amygdala är nära besläktad med minne, även om amygdala inte bildar minnen på egen hand.
Att konditionera ett rädslasvar är en viktig länk mellan amygdala och minnet, men denna struktur påverkar faktiskt minnet på andra sätt. Amygdala verkar reglera hur andra hjärnregioner kodar för långtidsminnen. När större grader av känslomässig upphetsning under en händelse aktiverar denna del av hjärnan, verkar händelsen vara starkare kodad och lättare återkallas. Denna koppling mellan amygdala och minne kan förklara varför människor lättare kommer ihåg traumatiska händelser, och än de utan känslomässigt innehåll.
Förmågan hos amygdala och minne att arbeta tillsammans kan vara avgörande för överlevnad. Det är också viktigt att notera att det kan vara ett underskott att ha för stark anknytning och att komma ihåg skrämmande eller traumatiserande händelser för lätt. En teori bakom posttraumatisk stressyndrom (PTSD) är att stressande stimuli, eller stimuli som liknar den initiala traumatiska händelsen, överaktiverar amygdala. I sin tur påminner individen med PTSD om den traumatiserande händelsen, tillsammans med de negativa känslor som till en början följde den. En liknande överaktivering kan också vara ett kännetecken för vissa former av ångeststörningar.
Även positiva känslor kan underlätta lagringen av minnen. Emotionell upphetsning av alla slag leder till synkroniserad aktivitet i amygdala, vilket kan kopplas till en ökad förmåga att bilda neuronala förbindelser. Dessa stärkta förbindelser kan främja interaktion som gör att minnen kan återkallas snabbare. Större amygdalae kan ha en större förmåga att utföra denna bedrift.