Ribonukleinsyrakoncentration (RNA) är ett mått på hur mycket av detta genetiska material som finns i ett prov. Denna nukleinsyra är en av livets viktiga byggstenar, avgörande för att organismer ska fungera, från valar till huskatter. Det kan analyseras i test av en mängd olika skäl, inklusive diagnostiska syften, forskning och rättsmedicinsk analys. Innan det kan testas måste det bearbetas och kontrolleras noggrant för att bekräfta att provet är av god integritet och kommer att ge korrekta resultat.
Vid bearbetning extraherar tekniker RNA från ett prov så att de kan analysera det. Detta kan innebära behandling med enzymer som tar bort deoxiribonukleinsyra (DNA) och proteiner som kan finnas i provet. Noggranna kontroller är nödvändiga för att begränsa riskerna för kontaminering och bevara så mycket RNA som möjligt. Specialiserade glasvaror och laboratorieplaster kan användas för denna process, och tekniker följer också en standardlabbprocedur för konsistens.
Den klassiska metoden för att mäta RNA-koncentration innebär att köra ett prov genom en spektrofotometer, en anordning som mäter ljusabsorption. Avläsningar kan ge information om hur mycket RNA som finns baserat på hur mycket ljus i specifika våglängder som absorberas. Detta kan också indikera om föroreningar finns i ett prov, eftersom andra material absorberar ljus i olika våglängder. Således kan testet utföra en dubbel funktion genom att kvantifiera RNA:t och bedöma det för kontaminering.
Ett annat alternativ är att lägga till ett färgämne till provet och exponera det för ljus för att se om färgen fluorescerar, och hur intensivt. Färgämnen kan binda tätt till nukleinsyror för att ge information om deras koncentrationer. En brist med denna metod är att RNA-koncentrationsvärdena kan vara avstängda om provet även innehåller DNA eller andra föroreningar, eftersom färgämnet kan binda till dessa också. Tekniker får endast använda detta alternativ för att bestämma RNA-koncentration om de är övertygade om att provet är mycket rent för att undvika att få falska resultat.
Om RNA-koncentrationen är för låg kanske provet inte går att använda. Det kanske inte räcker till att köra tester och dubbelkolla resultaten, till exempel. En ökad risk för fel kan också vara ett problem, eftersom problem med provet skulle förstoras om bara en begränsad mängd RNA är tillgänglig. Teknikern kan behöva rena en ny sats eller begära ett nytt prov, om detta är ett alternativ, för att avgöra om det är möjligt att få ett renare prov med en högre RNA-koncentration.