Ribonukleinsyra (RNA) extraktion är en laboratorieprocess som vanligtvis används inom molekylärbiologisk forskning. Genom att isolera RNA-strängar kan forskare studera de genetiska komponenterna i en mängd olika organismer, från bakterier till människor. Även om deoxiribonukleinsyra (DNA) är den vanligaste nukleinsyran förknippad med genetisk forskning, är RNA kopplingen mellan DNA och cellproteinerna som ansvarar för en mängd olika strukturella roller. Extraktion av RNA gör det möjligt för forskare att studera vägen från DNA-information till proteinproduktion och cellfunktion.
Nukleinsyror, i form av DNA och RNA, innehåller den genetiska information som behövs för att celler ska fungera och replikera. Ribonukleinsyra, eller RNA, är länken mellan DNA och cellproteiner. Specifika typer av RNA kopierar specifika sektioner av DNA för att hjälpa till med bildandet av sådana proteiner. Att följa vägen mellan DNA och cellproteiner hjälper forskare att förstå genreglering och proteinsyntes inom enskilda celler. Processer som underlättar RNA-extraktion och säkerställer provstabilitet ger forskare ett sätt att följa vägen mellan DNA och RNA.
Under RNA-extraktion reduceras och renas biologiska prover i sådan utsträckning att RNA isoleras för senare undersökning. Molekylära komponenter, såsom proteiner, RNA och DNA, partitioneras eller isoleras vid olika tidpunkter, vilket möjliggör extraktion av specifika typer av RNA. Olika vävnader och celltyper kräver olika metoder för RNA-extraktion. Medan det finns en mängd olika metoder för att utföra RNA-extraktion, använder de vanligaste centrifugeringarna för att blanda biologiska prover med olika kemiska föreningar, gemensamt kända som denatureringsmedel.
En vanlig metod för RNA-extraktion är fenol-kloroformextraktion, även känd som PC eller PCIA. Med denna metod blandas vävnadsprover med lika delar fenol och kloroform. Känd som en bifasisk blandning, centrifugeras lösningen i en denaturerande lösning. Två faser resulterar, varvid den första är den vattenhaltiga fasen och den andra är den organiska fasen. Det är under vattenfasen som RNA-extraktion sker, med hjälp av etanolfällning.
Andra metoder för att extrahera RNA varierar beroende på provstorlek, vävnadstyp och om totalt eller partiellt RNA krävs. För jäst-, växt- eller djurprover, komplett RNA eller totalt eukaryot RNA, behövs prover. Bakterier, å andra sidan, kräver totalt prokaryotiskt RNA. Varje typ av RNA kräver en annan metod för provberedning, extraktion och lagring.
Komplikationer med RNA-extraktion är vanliga och relaterar i allmänhet till nedbrytningen av RNA efter extraktion. Ribonukleasenzymer som vanligtvis finns i vävnadsprover bryter snabbt ned RNA. Om den inte används snabbt kan RNA-nedbrytning göra ett prov oanvändbart. Som svar inkluderar många metoder för RNA-extraktion steg för beredning av prover för lagring, både före och efter extraktion, för att minska eller bromsa nedbrytningen av RNA.