Vad är ribosomal RNA-sekvensering?

Ribosomal ribonukleinsyra (RNA)-sekvensering är processen för att bestämma sekvensinnehållet i de nukleinsyror som utgör ribosomen. I nästan alla celler är ribosomer makromolekyler som bygger proteiner för att hålla cellen igång. De består av RNA och en mängd olika proteiner som hjälper RNA:t att arbeta mer effektivt. Mycket av detta material i en ribosom är direkt involverat i proteinuppbyggnaden, så att bestämma ribosomal RNA-sekvensering kan ge insikter om den slutliga strukturen av molekylen, såväl som hur den fungerar. Funktionen och den allmänna strukturen hos RNA:t är väl bevarad mellan en mängd olika arter, men den råa sekvensen är det inte, och förändringar i sekvensen kan användas för att sluta sig till information om ribosomens utveckling.

Oavsett om det används för bakteriella ribosomer eller de av mer komplexa organismer, utförs ribosomal RNA-sekvensering på ett liknande sätt. När RNA:t är separerat från ribosomen dupliceras det många gånger och bryts sedan isär i små fragment vars sekvenser lätt kan identifieras. Dessa små sekvensbitar sätts sedan ihop igen för att generera den nyligen bestämda sekvensen. Uppgiften blir mer komplicerad när en sekvens blir längre, men processen är fortfarande relativt lätt för ribosomalt RNA, som är jämförelsevis litet. Det finns ingen garanti för att ett första försök med ribosomal RNA-sekvensering kommer att vara korrekt första gången, så flera försök att verifiera datakvaliteten utförs vanligtvis.

Data som erhålls från ribosomal RNA-sekvensering kan användas för en mängd olika ändamål, men en av de vanligaste är för bakteriell identifiering. Bakteriellt ribosomalt RNA i synnerhet är mycket konserverat mellan arter, så sekvensering gör att de unika egenskaperna hos en art kan konsolideras till en profil för referens. Denna profil kan användas för att snabbt och enkelt identifiera en specifik typ av bakterier, ett test som kan hjälpa till vid diagnos och behandling av sjuka. Med tillkomsten av bättre sekvenseringsteknik har detta tillvägagångssätt blivit vanligare vid diagnoser.

En andra inverkan ribosomal RNA-sekvensering kan ha på människors hälsa är att hjälpa utformningen av läkemedel och läkemedel. Bakteriella ribosomala RNA-sekvenser har många undersekvenser som är unika för bakterier, så att rikta in sig på dessa regioner med antimikrobiella läkemedel kan döda bakterier utan att vara skadligt för människor. Ribosomalt RNA-sekvenseringsdata i sig ger inte tillräckligt med data för att skapa läkemedel, men det ger forskare regioner att fokusera på för framtida studier och läkemedelsdesign. Medicinska molekyler kan konstrueras som fäster vid sekvenserna och inaktiverar ribosomen. En mängd olika nuvarande läkemedel använder denna teknik för att bekämpa sjukdomar.