Pseudomonas putida är en typ av gramnegativ bakterie som vanligtvis finns i vatten och jord, särskilt runt växternas rötter. Det kan skydda växter från sjukdomar från andra mikroorganismer. Dess ämnesomsättning är mycket komplex, och bakterierna kan bryta ner en mängd olika organiska föroreningar. Det finns ett kommersiellt intresse av att använda den för detta ändamål. Normalt anses bakterierna vara säkra, men det finns några få fall av att de har orsakat sjukdom hos personer med nedsatt immunförsvar.
Föroreningar som tidigare ansågs vara icke-biologiskt nedbrytbara, som Styrofoam™, har sedan dess visat sig brytas ned av denna organism. På grund av de biologiska och kemiska tillämpningarna av dessa bakterier har DNA-sekvenserna för ett antal stammar sekvenserats. De är nära besläktade med Pseudomonas aeruginosa, en opportunistisk patogen hos människor. Genom sekvensering fann man att Pseudomonas putida saknade nyckelgener som Pseudomonas aeruginosa använder för att orsaka sjukdom hos människor. Det kan till exempel inte bryta ned cellmembran eller frigöra gifter.
I de få fall där Pseudomonas putida har visat sig vara patogen hos människor, var det bland människor som redan var sjuka. Ett annat gemensamt drag var att bakterierna fördes in på något som skulle vara sterilt. Till exempel, i ett fall var en anti-dimmlösning förorenad med bakterierna. I andra sattes oserila katetrar eller liknande anordningar in i en person som nyligen tagit antibiotika.
Väl i kroppen kan Pseudomonas putida orsaka systemiska infektioner, såsom bakteriemi – en infektion i blodet. Lunginflammation eller peritonit är allvarliga sjukdomar som kan orsakas av denna bakteriella agent. Det kan också orsaka mer lokaliserade infektioner, som bihåleinflammation eller urinvägsinfektioner.
I allmänhet har Pseudomonas putida utsetts som en säker bakterie för användning vid kloning av gener för bioremedieringsarbete. Detta innebär systemisk användning av organismen för att bryta ned föroreningar i vatten eller mark. Dessa bakterier har en mycket mångsidig ämnesomsättning och kan bryta ner en mängd giftiga kemikalier, inklusive bensinkomponenter. Andra stammar kan omvandla förpackningsjordnötter, gjorda av polystyrenskum, till en biologiskt nedbrytbar plast. Det pågår mycket forskning om denna organisms nedbrytande förmåga.
Pseudomonas putida är också viktig för att upprätthålla växthälsa. Den lever i de flesta jordar och associerar med växtrötter, där den ofta förbättrar växthälsan. Organismen producerar också molekyler som binder järn från området runt växten. Detta berövar svampar och andra bakterier ett nödvändigt näringsämne, vilket begränsar deras tillväxt. Genom att göra det kan det påverka den biologiska kontrollen av vissa växtpatogener.
Det finns många forskningsvägar som använder Pseudomonas putida för genteknik. Rekombinanta bakterier produceras för att bryta ned specifika föroreningar och för att leverera biobekämpningsmedel till växtrötter. De används också för att uttrycka gener från Pseudomonas aeruginosa som kan vara inblandade i att orsaka sjukdom hos människor. Forskare föredrar att utföra sådana experiment i Pseudomonas putida, eftersom det är mycket osannolikt att orsaka sjukdom hos människor jämfört med Pseudomonas aeruginosa.