Peptidmolekylvikt är ett tal utan enheter som härleds från förhållandet mellan en medelmassa av en peptidmolekyl dividerat med en tolftedel av massan av en atom med kol 12. Peptidmolekylvikten kan också beskrivas som en mol av peptiden i gram, som en mol är en mängd av peptiden som är lika med dess molekylvikt. Därför, eftersom aminosyravikten för prolin, till exempel, är 97.12, är en mol prolin lika med 97.12 gram av ämnet.
Det är viktigt att känna till antalet peptidmolekylvikter i processer som peptidsyntes, eftersom vikten kan användas för att bestämma koncentrationen av molekylära komponenter. Till exempel, om en komponent hade en molekylvikt på 50 och en annan hade en molekylvikt på 100, så skulle molekylerna i den andra föreningen väga dubbelt så mycket som de i den första föreningen. Om de båda kombinerades i lika gram, skulle den lägre viktföreningen ha dubbelt så många molekyler närvarande i blandningen, eftersom de bara vägde hälften så mycket, och istället för en 50/50-koncentration skulle det finnas en koncentration på cirka 66 /33.
Molekylviktsanalysprogramvara används ofta för att beräkna peptidmolekylviktstal, eftersom beräkningarna annars kan vara komplicerade. Det finns inte bara en mängd olika kemiska elementmolekylvikter att ta hänsyn till i aminosyrasekvenser som utgör peptider, utan det finns också andra faktorer att ta hänsyn till. Både hydrofoba och hydrofila egenskaper i förhållande till vatten spelar in, liksom molära absorptionskoefficienter för själva proteinerna. Avogadros tal, som representerar hur många molekyler som finns i en mullvad, måste också användas när man bestämmer en peptids volym utifrån peptidens molekylvikt.
Aminosyror är byggstenarna för peptider. De sträcker sig från en restmolekylvikt, som är den faktiska vikten minus vatten, på 57.05 för den minsta molekylen, glycin, upp till 156.19 för den största molekylen, arginin. När två eller flera aminosyror kombineras används ofta en peptidmolekylviktskalkylator för att bestämma den nya molekylvikten.
Att bestämma en exakt peptidmolekylvikt har viktiga tillämpningar i en mängd olika forskning. Bevis visar till exempel att lågmolekylära peptider är viktiga regulatorer inom biologi. Hormoner som innehåller dessa peptider är aktiva i delar av kroppen, såsom hjärnan, nervsystemet och mag-tarmkanalen.