Termen grafik syftar på ritningar eller bilder som skapas enligt matematikens regler. Molekylär hänvisar till molekyler och deras komponenter. Därför är en betydelse av molekylär grafik (MG) studiet av molekyler genom visualisering av själva molekylerna och deras beståndsdelar. Molekylär grafik hänvisar också till de tredimensionella avbildningarna av molekyler som görs för att undersöka dem och förstå deras svar under reaktioner och interaktioner
Molekylär grafik har vissa fördelar jämfört med fysiska modeller. Fysiska modeller kan orsaka problem eftersom strukturen är skymd, det finns ett felaktigt intryck av flexibilitet, överlagring är nästan omöjligt, eller så är de helt enkelt för besvärliga att arbeta med. Alla dessa problem kan övervinnas med datorgrafik.
En viktig användning av molekylär grafik är i studiet av proteiner och nukleinsyror. Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB) proteindatabank (PDB), där experimentellt bestämd information om strukturerna hos nukleinsyror, proteiner och komplexa sammansättningar lagras för allmän åtkomst. Den 27 april 2010 fanns det 64,932 3 strukturer i databasen. RCSB populariserar deras funktion med en inbjudan till besökare att bygga XNUMXD-virusmodeller vid Rutgers University på Rutgers Day. RCSB sponsrar också proteinmodelleringsförsök vid regionala Science Olympiads i USA. The Worldwide Protein Data Bank (wwPDB) är den internationella organisation som grupper som RCSB; PDBe, den europeiska motsvarigheten; och PDBj, den japanska motsvarigheten; tillhöra.
Ett annat område där molekylär grafik är extremt viktigt är designen av läkemedel. Molecular-graphics assisted drug design – även känd som datorassisterad läkemedelsdesign (CADD), datorstödd molekylär design (CAMD) eller strukturbaserad läkemedelsdesign (SBDD) – är ett av de viktigaste forskningsintressena för fakulteten som är involverad i Virginia Commonwealth University Medicinal Chemistry specialisering i Pharmaceutical Sciences doktorandprogram, till exempel.
Specialiserad programvara för att skapa molekylär grafik, kallad mjukvara för molekylär design, finns tillgänglig i ett antal kommersiella paket. Det finns också särskilda versioner som ägnas åt molekylär-grafikbaserad läkemedelsdesign. Inom läkemedelsdesign är dockningsfunktionen – möjligheten att koppla en visad molekyl till en receptor – ett av nyckelegenskaperna som särskiljde läkemedelsdesignmjukvaran från annan molekylär designprogramvara.