Grundämnesforskare använder mikrovågsrötning som en sur nedbrytningsmetod för att lösa upp metaller i syfte att uppnå mätningar relaterade till atomära utsläpp eller för att uppnå atomabsorption. Således definieras mikrovågsrötning som en teknik som används för att lösa upp metaller i syra genom att höja både temperaturen och trycket genom applicering av strålning. Mikrovågsugnar utformade för laboratorieanvändning är de verktyg som vanligtvis används för att utföra processen. Fördelarna med processen kretsar kring att minska tiden det tar att uppnå matsmältning, vilket är en fråga om minuter genom användningen av mikrovågsrötning, i motsats till timmar som använder andra fungerande metoder som kokplattor. Avgörande för att genomföra processen säkert och korrekt är dock att se till att både mikrovågsugnen och provet förbereds korrekt.
Att förbereda mikrovågsugnen för att bearbeta mikrovågsprovet både säkert och effektivt är viktigt för processen. Säkerhetsproblem kretsar kring att veta hur man använder mikrovågsugnen korrekt. Instruktioner för att göra det kommer att variera mellan olika modeller som används i laboratorier. Därför måste studenter och forskare läsa igenom ugnens bruksanvisning innan de försöker använda den. Dessutom publicerar laboratorier vanligtvis specifika policyer för att använda sådan utrustning på plats, och användare måste bekanta sig med dessa policyer och följa dem.
Å andra sidan är förberedelsen av provet ganska enhetlig oavsett förberedare. Medan vissa prover förbereds lite annorlunda än andra, kommer alla prover att ha några förberedelseregler som måste följas. Att genomföra processen innebär att man lägger en sur lösning inuti ett kärl som kan hantera sura lösningar och strålning, och sedan tappar provet inuti kärlet innan det försluts. Förberedelse av provet kräver att det är rent och torrt innan det utsätts för syra, medan kärlet följer samma standarder. Ytterligare fukt eller partiklar kan göra att mikrovågsugnen blir för varm inuti och smälter kärlet som innehåller lösningen, vilket skapar en farlig situation.
Försmältning är också ett viktigt steg som måste tas när man förbereder okända prover för mikrovågsrötning. Detta är också ett obligatoriskt steg om provet misstänks innehålla reaktiva ämnen. Vanligtvis involverar processen att förbereda provet i förväg och sedan låta kärlet stå på disken under en period av minst 15 minuter för att urskilja en reaktion innan provet underkastas mikrovågsuppslutning. Oavsett provet är det också viktigt att notera att när matsmältningen är klar kommer alla laboratorier att ha publicerat en rekommenderad nedkylningsperiod innan de tas ut ur mikrovågsugnen. Alla användare måste följa policyn som publicerats för att minska risken för en farlig olycka.