Mikroskopisk bildbehandling används för att producera och analysera bilder som förvärvats från ett mikroskop inom områden som medicin, biologisk forskning och metallurgi. Många mikroskop som tillverkas idag inkluderar digital bildbehandling, och mikroskopisk bildinsamling är nu enklare än tidigare på grund av framsteg inom digital bildteknik. Dessa högtekniska bildbehandlingstekniker ger tydliga och skarpa mikroskopiska bilder. Tvådimensionell (2D) och tredimensionell (3D) bildmanipulation tillåter också forskare att tillhandahålla en mer detaljerad analys av mikroskopiska bilder.
Det första steget i mikroskopisk bildbehandling är att få den första bilden eller bilden. Silverhalogenidens mikroskopiska bilder från det förflutna har ersatts med digitala bildbehandlingssystem som används för att manipulera, redigera och lagra bilder som tagits genom ett mikroskop. Upplösningsnivån för digitala bildenheter som används i mikroskopisk bildbehandling kan vara så hög som 32 bitar, mycket högre än de åtta eller 12 bitars nivåer som finns i vanliga digitalkameror. Bearbetning av dessa högupplösta bilder kräver vanligtvis användning av en kraftfull dator, en avancerad digitalkamera och programvara för digital bildbehandling. De flesta moderna mikroskop är utrustade med digitala bildinsamlingsmöjligheter.
Olika typer av bildmanipuleringsprocesser har utvecklats för att ge en mer exakt återgivning av mikroskopiska bilder. Vissa av dessa processer används för att minska bildbrus, justera för ljusstyrka, öka kontrasten eller förbättra bilden på något sätt. Till exempel, att bli av med vissa förvrängningar i en bild använder en process som kallas deconvolution. Denna process gör den mikroskopiska bilden skarpare och tydligare med hjälp av en serie komplexa algoritmer. Dessa flerdimensionella mikroskopiska bildbehandlingstekniker gör det möjligt för forskare att ta bilder och konvertera dem till mer användbara visuella former för studier och forskning.
Mikroskopisk bildanalys görs med hjälp av olika datorapplikationer, som var och en ger olika typer av information. Till exempel kan en mikroskopisk bildbehandlingsapplikation identifiera gränserna för en cellvägg, beräkna arean av ett objekt eller tillhandahålla andra mätningar. Analysprogramvara tillåter användare att manipulera bilder på många olika sätt, som att skapa en videosekvens som kommer att spåra rörelsen hos särskilda objekt eller märka delar av en cell. 2D- och 3D-bildrekonstruktion och -animering ger användarna ytterligare en uppsättning analytiska verktyg. Andra funktioner inkluderar automatiska räknefunktioner, bildkommentarer eller tillägg av annan data till de individuella mikroskopiska bilderna.