Mikrobiell patogenes är den process genom vilken en mikroorganism orsakar en sjukdom. Mikroorganismer med förmåga till mikrobiell patogenes inkluderar bakterier, svampar och virus. Former av dessa organismer som orsakar sjukdomar kallas patogener. Mikrobiell patogenes spårar ursprunget och orsaken till sjukdomen, hur den visar sig i kroppen och hur kroppen reagerar på den.
Det finns fyra huvudtyper av patogenes i människokroppen. Inflammation är svullnad av vävnad i kroppen när ett problem hanteras och infekterad vävnad ersätts. Malignitet är den onormala utvecklingen av cellreproduktion som ofta förekommer i cancer. Vävnadsnedbrytning eller nekros är att celler dör utanför den normala cellcykeln. Infektion uppstår när celler infekteras av bakterier, virus av svampsporer.
Infektioner är den mest troliga formen av mikrobiell patogenes, även om inflammationer kan uppstå som en biprodukt av infektionen. Varje sådan infektion kan delas in i tre breda kategorier. En akut infektion är relativt kort, ändlig och med ett snabbt insättande. En kronisk infektion är mer långvarig och svår att hantera. En återkommande infektion kan ha en snabb eller långsam debut, men kommer att försvinna som om den läkts för att komma tillbaka vid ett senare tillfälle.
Varje infektion genom mikrobiell patogenes sker i tre breda stadier. Dessa är den initiala infektionen, reproduktionen och artens fortsättning. De två sistnämnda är huvudorsakerna till eventuell infektion. Mikroorganismen kräver en större organism som en människa för att föröka sig och sprida sig. Multiplikation eller replikering sker ofta inom en cell.
Målet för mikroorganismen när den väl har börjat replikera sig själv är att få ut versioner av sig själv ur kroppen innan kroppens självförsvarsstyrkor förstör den. Kroppen svarar vanligtvis med en blandning av vita blodkroppar, även kallade makrofager, och antikroppar. Mikroorganismen kommer därför att försöka ta sig ut ur kroppen för att infektera någon vars immunsystem inte är inrättat för att stöta bort det omedelbart.
Detta innebär att den inledande fasen av infektionen och den sista fasen av överföringen är outplånligt kopplade – det finns fyra huvudsakliga sätt för mikrobiell patogenes att överföra från en person till en annan. Den första är genom aerosoler som vattendroppar vid hosta och nysningar. Den andra är genom förtäring eller genom fekal materia. Den tredje är vektorburen, som den bärs av andra djur som myggor och fästingar. Den fjärde huvudvägen är genom utbyte av kroppsvätskor under sex, blodtransfusioner och kyssar.
Framgången för infektionen beror också på många faktorer. Mikroorganismens natur och hur den replikerar är en faktor. En annan är immunstatusen hos den infekterade individen. Om individen har haft kontakt med mikroorganismen tidigare är chansen stor att kroppen är väl förberedd för att stöta bort den.