Mag-tarmsystemet är ett av kroppens system som primärt ansvarar för bearbetning av livsmedel, absorption av näringsämnen och eliminering av kroppsavfall. Den består av långa rörliknande ihåliga organ som börjar med munnen, ner till matstrupen, magen och tarmarna och slutar med anus. Detta system är mestadels uppdelat i olika sektioner av ringliknande muskler som kallas sfinktrar. Andra tillbehörsorgan i mag-tarmsystemet inkluderar tänderna, tungan, spottkörtlarna, bukspottkörteln, gallblåsan och levern.
När maten väl kommer in i munnen bryter tänderna ner maten i mindre bitar och spottkörtlarna utsöndrar saliv, som innehåller enzymer som hjälper till att fukta maten och starta nedbrytningen av kolhydrater. Tungan hjälper till att driva maten in i svalget för att sväljas ner till matstrupen, som är cirka 9.8 tum (cirka 25 cm) lång. Genom matstrupens vågliknande rörelser, även känd som peristaltiken, trycks mat in i magsäcken. Mellan matstrupen och magsäcken finns den nedre matstrupssfinktern (LES), som öppnas för att maten ska kunna komma in i magen och sedan stängs för att förhindra att maten går upp igen.
Rörelser i magen tillåter blandning av mat med magsaft och enzymer, förvandlar den till mindre bitar och gör den halvflytande i konsistensen. Magen rymmer vanligtvis 1500 ml (cirka 50 uns) mat, men kan rymma ungefär dubbelt så mycket. Andra funktioner i magen inkluderar lagring av mat, absorption av vissa näringsämnen i maten och dödande av bakterier genom inverkan av magsyror. Efter att ha bearbetat mat i magen går den genom pylorussfinktern, som ligger mellan magen och tolvfingertarmen. Duodenum är den första delen av tunntarmen, följt av jejunum och ileum.
I tunntarmen, som har en total längd på cirka 19.6 fot lång (cirka 6 meter), blandas maten med ämnen från bukspottkörteln, levern och gallblåsan för vidare bearbetning. Huvudfunktionen hos tunntarmen i mag-tarmsystemet är absorptionen av näringsämnen, som vitaminer, aminosyror och glukos, från maten. Dessa näringsämnen går sedan in i blodomloppet för att användas av kroppen för korrekt funktion.
Ileocekalklaffen tillåter material från tunntarmen att komma in i tjocktarmen. I tjocktarmen, som är cirka 5 fot lång (1.5 meter), sker återabsorption av vatten och andra ämnen och bildning av fekalt material. Förekomsten av bakterier i tjocktarmen i mag-tarmsystemet är viktiga vid bearbetningen av vissa vitaminer, såsom K och B12, inuti kroppen. Fekalt material skjuts sedan längs med tjocktarmen mot ändtarmen för att drivas ut ur anus genom avföringsprocessen.