Immunmodulerande terapi består av en serie av tre typer av behandlingar för sjukdomar som plågar det mänskliga immunförsvaret, och det kallas oftare för just immunterapi. De tre typerna av immunmodulerande terapistrategier involverar användningen av immunsuppressiva läkemedel för att minska immunsystemets naturliga verkan eller användningen av immunstimulerande läkemedel för att förbättra dess respons, och användningen av tolerogener som konditionerar immunsystemet att tolerera vävnad som t.ex. av transplanterade organ. Varje klass av behandlingar är avsedd för specifika immunsystemproblem. Immunsuppressiva läkemedel och tolerogener används tillsammans för att behandla autoimmuna sjukdomar som multipel skleros (MS) och organtransplantationer där kroppen angriper sin egen vävnad. Immunstimulerande läkemedel ges för att stärka immunförsvaret i fall där det är försvagat, som till exempel vid cancer, AIDS och andra livshotande infektioner.
I de fall immunmodulerande terapi används i en immunsuppressiv roll, kan själva behandlingen fungera något i mörker. Med multipel skleros vet man fortfarande lite om patogenesen eller uppkomsten och utvecklingen av sjukdomen över tid. Rollen av immunmodulerande terapi i sig för att lindra en del av lidandet av ett sådant tillstånd är också dåligt förstådd, men behandlingen har varit den enda tillgängliga metoden som finns för att hjälpa patienter med MS från och med 2004. På grund av de fördelar som den erbjuder för kroniskt sjuka patienter, immunmodulerande terapi bestående av fyra immunmodulerande mediciner och en immunsuppressiv medicin har getts till patienter i USA sedan 1993. Behandlingarna är godkända av US Food and Drug Administration (FDA), även om en fullständig förståelse för hur de fungerar är oklar .
Med både immunstimulerande och immunsuppressiva behandlingar är förutsättningen att breda effekter på immunsystemet totalt sett kommer att ha ett allmänt användbart resultat vid behandling av vilket tillstånd som helst. Tanken är att sådana immunmodulerande terapiläkemedel ospecifikt stimulerar verkan av det mänskliga immunsystemet även om läkare och forskare inte har kunnat spåra direkta orsak-och-verkan resultat från behandlingarna från och med 2011. Stödet för att fortsätta sådana behandlingar har hittills varit helt baserat på empiriska bevis, eller bevis på erfarenhet och observationer inom området av medicinsk personal utan grundliga vetenskapliga data och teorier för att backa upp sina antaganden.
På grund av detta empiriska tillvägagångssätt med immunmodulerande terapi har det förekommit viss kontrovers inom det medicinska området om huruvida sådana tillvägagångssätt verkligen är berättigade. Detta gäller särskilt vid behandling av infektioner med sällskapsdjur, såsom återkommande hudsjukdomar, där immunstimulerande läkemedel ordineras. Sådana tillstånd kan ha bakomliggande orsaker som inte är baserade på ett felaktigt immunsystem. Om behandlingen avbryts kan tillståndet därför återkomma och cykeln måste fortsätta igen, eftersom den inte orsakades av en immunbrist i första hand.