Historien om statens sigill Mississippi går tillbaka till 18-talet. Bilden som skulle bli den officiella sigillen valdes först 1798, när den antogs som sigill för Mississippi-territoriet. Det territoriella sigillet blev officiellt Mississippis statliga sigill när Mississippi fick status som stat 1817 och har behållit samma design sedan den tiden. Bildspråket av sälen är ännu äldre och har troligen influerats av källor som föregick existensen av delstaten Mississippi och själva USA i århundraden.
Mississippis statliga sigill föreställer en guldskallig örn på en vit bakgrund. Örnen håller pilar i en av sina klor och en olivkvist i den andra, som representerar krig och fred. På örnens bröst finns en sköld, med en grupp vita stjärnor på ett blått fält i det övre området av skölden och en serie vertikala röda och vita ränder under den. Örnen är omgiven av en blå cirkel, med orden ”The Great Seal of the State of Mississippi” lindade runt den i guldbokstäver och omgiven av en andra, större blå cirkel.
Sälens historia sträcker sig faktiskt bortom delstaten Mississippi som den finns idag. Vid tiden för sigillens ursprungliga adoption som sigill för Mississippi-territoriet, omfattade det territoriets gränser inte bara den moderna delstaten Mississippi utan även Alabama. När Mississippi blev en stat 1817, antogs territoriellt sigill av den nyetablerade staten Mississippi, medan resten av det som varit Mississippi-territoriet omnämndes av kongressen till Alabama-territoriet tills staten Alabama antogs till unionen år 1819.
Det huvudsakliga inslaget i bilden, den kala örnen som håller pilar och en olivkvist i klorna och bär en röd, vit och blå sköld på bröstet, är baserad på den liknande örn som avbildas på USA:s stora sigill. Den amerikanska sigillen, där örnen håller en olivkvist och 13 pilar för att representera de ursprungliga 13 staterna, antogs av kongressen 1782 efter att en serie kommittéer tillbringat sex år med att överväga olika design. Vithövdad örnar som greppar pilar visas också på sigillen i delstaterna New Mexico och Utah, och sigillen i Illinois och Pennsylvania visar också en örn som stöder en sköld.
Bilden av en örn som bär en sköld, eller av en örn eller något annat djur som håller eller ligger nära en grupp pilar eller en olivkvist, går ännu längre tillbaka. En örn som stöder en sköld förekommer i viss heraldik och mynt från kontinentala Europa, även om användningen av en skallig örn, en art som är hemma i Nordamerika, var en innovation. Republiken de sju förenade Nederländernas vapen, allmänt känd som den holländska republiken, föreställde ett lejon som håller ett svärd i sin främre högra tass och sju pilar, en för var och en av de sju provinserna. Den holländska republiken var världens främsta exempel på en republikansk regering som bildades genom en konfederation av enskilda stater vid den tidpunkt då USA:s sigill antogs, och den holländska konstitutionen var ett inflytande på många av USA:s grundares politiska tankar. Således kan denna bild också ha varit en inspiration för USA:s stora sigill och följaktligen statens sigill Mississippi.