Historien om statens flagga i New Hampshire skildrar statens starka stöd av Amerikas förenta stater efter att nationen blev självständig från Storbritannien 1781. Avbildad på flaggan är statens sigill i New Hampshire, omgiven av en ring med nio stjärnor varvat med lagerblad på mörkblå bakgrund. New Hampshire State Legislature antog sin officiella flagga 1909. Innan dess hade New Hampshire ingen officiell delstatsflagga, utan flaggade de olika delstaternas regementen.
New Hampshires delstatsflagga speglar flera andra statliga symboler som påminner om det amerikanska självständighetskriget från Storbritannien. Nio stjärnor representerar New Hampshire som den nionde staten att ansluta sig till det nybildade USA den 21 juni 1788. New Hampshires statssigill, som vilar på mitten av flaggans djupblå bakgrund, föreställer det historiska krigsfartyget USS Raleigh, byggt i Portsmouth , New Hampshire, 1776. USS Raleigh var ett av de första tretton fregattkrigsfartygen som beställdes av den kontinentala kongressen. Detta krigsfartyg är också känt som det första fartyget att bära den amerikanska flaggan i sjöstrid.
Ursprungligen illustrerade statens sigill i New Hampshire en tall med upprättstående fiskar flankerade av buntar av pilar. Den första provinskongressen skapade sigillen 1775 för att spegla New Hampshires naturresurser bland kolonierna. Den nya lagstiftaren i New Hampshire ändrade sigillen 1784 för att representera ett skepp före en stigande sol, men antog inte officiellt sigillen som en statlig standard. Konstnärer har fritt utarbetat sigillen under åren, till stor nöd för statliga lagstiftare, med tillägg av sjömän på fartyget eller dess brygga och till och med lastade med tunnor rom. År 1909 standardiserade New Hampshire-församlingen statens sigill och reviderade den 1931 till den slutliga bilden som avbildas idag.
Statens flagga i New Hampshire röstades fram av medlemmar i North American Vexillological Association (NAVA) som en av de tio värsta flaggorna i Nordamerika. Föraktad som en typ av ”sigill på ett lakan” är New Hampshires flagga inte alls lika distinkt och klart förståelig som de djärva och färgglada flaggorna i andra stater, som statens flaggor i Texas, Arizona och Alaska. New Hampshires delstatsflagga sticker också ut genom att vara den enda delstatsflaggan som avbildar en annan stat. Inne i statens sigill vilar USS Raleigh på Portsmouths flotta varv, ursprungligen i Massachusetts men nu beläget i Maine.