Baktarmen är den bakre eller sista delen av matsmältningssystemet, föregås av framtarmen och mellantarmen. Den består av den nedre halvan av tjocktarmen: den senare tredjedelen av den tvärgående tjocktarmen, hela den nedåtgående tjocktarmen och sigmoid tjocktarmen och ändtarmen. Baktarmen är den del av matsmältningskanalen som är ansvarig för absorptionen av vatten och eliminering av avfall från kroppen i form av osmält mat.
Tarm hänvisar till matsmältnings- eller mag-tarmkanalen såväl som de accessoriska matsmältningsorganen, som tillsammans utgör matsmältningssystemet. Förtarmen är den övre delen av detta system och inkluderar munnen, matstrupen, magen, levern, bukspottkörteln, gallblåsan och de två första segmenten av tolvfingertarmen, början av tunntarmen. Nästa är mellantarmen, den mellanliggande delen av matsmältningskanalen. Den inkluderar de två senare segmenten av tolvfingertarmen och de återstående delarna av tunntarmen, jejunum och ileum, samt den övre halvan av tjocktarmen: blindtarmen, uppåtgående tjocktarm och första två tredjedelar av den tvärgående tjocktarmen.
Den sista tredjedelen av den tvärgående tjocktarmen, som skiljer sig från de proximala två tredjedelarna genom att den får sin blodtillförsel från den nedre mesenteriska artären snarare än den övre mesenteriska artären, markerar början av baktarmen. Detta är den del av tjocktarmen som korsar bålen horisontellt, precis under magen och andra matsmältningsorgan, innan den vrids 90 grader vid böjningen som kallas mjältfixturen för att bilda den nedåtgående tjocktarmen. Efter att ha sjunkit ner i bäckenet vänder det sig sedan 90 grader igen för att bilda ytterligare en horisontell sektion av tjocktarmen, sigmoid-tjocktarmen. Slutligen vänder den nedåt igen för att bilda ändtarmen, som tar ut avfall från kroppen via analsfinktern.
Till skillnad från de två föregående sektionerna av tarmen, är baktarmen inte oroad över nedbrytningen och absorptionen av näringsämnen. Även om det är platsen där vatten och vissa elektrolyter absorberas – nämligen salt, kalium och vissa fettlösliga vitaminer som vitamin K – är dess huvudsakliga uppgift att ta bort osmält mat. När bakterier i tjocktarmen förvandlar denna osmälta mat eller chyme, ursprungligen flytande i form, till fast avfall via jäsning, skjuter glatt muskulatur i tarmväggen detta fekala material in i ändtarmen. Rektum fungerar som en tillfällig lagringsplats för avföringen tills den fylls till sin kapacitet, vid vilken punkt sträckreceptorer signalerar hjärnan att signalera avföringsmusklerna att dra ihop sig, vilket eliminerar detta avfall från baktarmen.