Både magen och tolvfingertarmen är delar av matsmältningssystemet. Maten kommer först in i magen, där den delvis bearbetas, och den går sedan in i tolvfingertarmen, den första delen av tunntarmen. Tolvfingertarmen är den första platsen i kroppen att absorbera näringsämnen från maten, när magen bryter ner den i ett förberedande steg.
Magsäckens funktion är att vara ett uppsamlingsområde för mat, och att tillsätta syra till maten för att hjälpa den att bryta ner. För att rymma en hel måltid är magen expanderbar. I grund och botten är det en stor påse som har en yttre täckning av muskler som kan krympa och expandera magen för att hjälpa till att mosa ihop mat. För att påskynda nedbrytningen av maten producerar magen även ämnen som magsyra och enzymer. Förutom att släppa ut ämnen inuti magsäcken skickar organet också biologiska signaler till hjärnan för att indikera om en person är mätt eller hungrig.
I matsmältningskanalen är magen och tolvfingertarmen fästa, och magen är först. Duodenum är en del av tunntarmen och följs av jejunum och ileum. Det är den punkt där kroppen absorberar alla nedbrutna komponenter i maten, för användning i resten av kroppen. Det latinska ordet duodenarius som betyder ”tolv”, är ursprunget till ordet duodenum, eftersom avståndet från början till slutet av denna del av matsmältningssystemet är cirka 12 fingerbredder. Magen och tolvfingertarmen är åtskilda av ett muskelområde i slutet av magen som kallas pylorus.
Eftersom maten i magen behöver bearbetas innan man går in i nästa steg i matsmältningen, tolvfingertarmen, en typ av biologisk gateway är nödvändig. Denna port mellan magen och tolvfingertarmen är pylorus, som drar ihop sig och expanderar för att skjuta maten vidare in i tolvfingertarmen. Pyloric sfinktern är en tight muskulös ring som blockerar maten från att komma tillbaka in i magen.
När maten rör sig mellan magen och tolvfingertarmen är den mycket sur. Ämnen som är alkaliska kommer in i tolvfingertarmen för att ge maten ett neutralt pH. De små matsmältningsorganen gallblåsan och bukspottkörteln producerar dessa alkaliska föreningar tillsammans med fler ämnen som kan smälta maten ytterligare. Kroppen kan sedan ta upp näring genom tolvfingertarmens vägg, och detta fortsätter vidare längs tunntarmen.