Den mänskliga hjärnan består av fyra huvudregioner: hjärnstammen, cerebellum, diencephalon och cerebrum. Beläget nära mitten av hjärnan består diecephalon av hypotalamus, thalamus och epitalamus. Av de tre sektionerna som utgör diecephalon är epitalamus den dorsala, eller längst bak. När det gäller funktion är epitalamus ansvarig för att ansluta lymfsystemet till resten av hjärnan, samt reglera hormoner som utsöndras av tallkottkörteln.
Tittar man på en sidovy av den mänskliga hjärnan, är epitalamus belägen strax ovanför medulla oblongata och hypofysen. Efter ryggmärgens väg in i skallen, övergår märgen in i hjärnan via medulla oblongata, som slutar i den nedre delen av mellanhjärnan. Strax ovanför och några centimeter framåt vilar hypofysen på en horisontell axel med ögon och öron. Över både medulla oblongata och hypofysen sträcker sig epitalamus och dess associerade komponenter.
Strukturer inom epitalamus inkluderar habenula, stria medularis och tallkottkroppen eller tallkottkörteln. Forskare förstår inte fullt ut alla funktionerna hos de olika strukturerna i epitalamus, även om vissa funktioner är uppenbara. Till exempel vet forskare att tallkottkörteln, som ligger på baksidan av epitalamus, är ansvarig för att reglera dygnsrytmen. Melatonin, hormonet som är ansvarigt för sömnighet, utsöndras av tallkottkörteln hos både människor och däggdjur för att inducera normala sömncykler.
Känd som det ”tredje ögat” deltar tallkottkottskroppen också i andra kroppsfunktioner. Produktionen av melatonin från den lilla tallkottkörteln är inte större än ett riskorn och hämmar även sexuell utveckling hos både människor och djur fram till tonåren. Känslor och vissa motoriska vägar påverkas också, på grund av nära likheter mellan melatonin och serotonin.
Bredvid tallkottkörteln finns habenula, även känd som habenulära kärnor. Forskare tror att habenula är involverad i att reglera kroppens intag av näringsämnen och vatten. Dessutom indikerar forskning att habenula innehåller affarenta eller sensoriska input, fibrer som förbinder stria medularis med andra delar av hjärnan som är involverade i frisättning av serotonin, dopamin och noradrenalin.
Stria medularis i thalamus sträcker sig bakåt mot de habenulära kärnorna. Lite är känt om stria medularis, förutom att det är ett knippe av efferenta, eller sensoriska uteffekter, nervfibrer strukturerade för att bilda en ås mellan thalamus och epitalamus. Vissa anatomidatabaser listar stria medularis som en del av thalamus, medan andra listar den som en del av epitalamus.